88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3909 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  51.61 
 
 
1785 aa  828    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  47.14 
 
 
1781 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  47.32 
 
 
2337 aa  717    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  50.8 
 
 
1051 aa  749    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  100 
 
 
1838 aa  3659    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  45.43 
 
 
1744 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  46.9 
 
 
1752 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  51.91 
 
 
1728 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  43.64 
 
 
1627 aa  698    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  44.71 
 
 
2135 aa  710    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  41.35 
 
 
1282 aa  602  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  40.57 
 
 
1389 aa  486  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  41.53 
 
 
824 aa  338  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  47.06 
 
 
1009 aa  322  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  41.15 
 
 
1589 aa  307  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  36.4 
 
 
1005 aa  267  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  34.95 
 
 
556 aa  240  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  33.07 
 
 
509 aa  218  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  31.01 
 
 
522 aa  176  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  54.43 
 
 
631 aa  172  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  30.14 
 
 
528 aa  169  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  32.57 
 
 
553 aa  156  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  29.8 
 
 
565 aa  153  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  30.05 
 
 
569 aa  132  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  28.24 
 
 
506 aa  131  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  28.85 
 
 
542 aa  131  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  28.19 
 
 
514 aa  129  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  28.54 
 
 
552 aa  127  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  29.29 
 
 
458 aa  126  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  40.38 
 
 
523 aa  123  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  45.39 
 
 
642 aa  120  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  25.77 
 
 
584 aa  115  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  39.47 
 
 
430 aa  109  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.75 
 
 
1066 aa  108  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  51.92 
 
 
119 aa  107  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  34.68 
 
 
614 aa  102  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.07 
 
 
1627 aa  96.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  34.51 
 
 
595 aa  90.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  25.74 
 
 
503 aa  87.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  32.9 
 
 
486 aa  87  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  33.91 
 
 
693 aa  85.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  27.78 
 
 
559 aa  82.4  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  31.76 
 
 
656 aa  80.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  27.54 
 
 
547 aa  77.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  32.41 
 
 
651 aa  76.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  33.18 
 
 
352 aa  76.3  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  25.14 
 
 
515 aa  75.9  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.17 
 
 
1669 aa  75.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  34.42 
 
 
1590 aa  73.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.25 
 
 
1686 aa  72.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  26.22 
 
 
448 aa  72.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  29.03 
 
 
628 aa  68.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  28.67 
 
 
482 aa  68.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.64 
 
 
2002 aa  66.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  39.64 
 
 
1026 aa  65.9  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.63 
 
 
2002 aa  65.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  34.88 
 
 
2117 aa  63.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  37.81 
 
 
648 aa  63.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  33.33 
 
 
1762 aa  62  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  36.94 
 
 
635 aa  57.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  26.91 
 
 
1748 aa  57.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  36.54 
 
 
767 aa  57.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  25 
 
 
546 aa  55.5  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.48 
 
 
2191 aa  55.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  21.51 
 
 
670 aa  55.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  25.73 
 
 
4761 aa  53.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.74 
 
 
451 aa  53.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.68 
 
 
2195 aa  52.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  32.32 
 
 
978 aa  52.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  37 
 
 
663 aa  52.8  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3939  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.91 
 
 
1757 aa  52.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  29.52 
 
 
692 aa  52.4  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  35.63 
 
 
457 aa  50.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  40.24 
 
 
426 aa  50.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  23.58 
 
 
3320 aa  50.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  36.47 
 
 
427 aa  50.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  37.5 
 
 
685 aa  50.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  35.29 
 
 
409 aa  50.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  35.71 
 
 
368 aa  49.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  32.56 
 
 
536 aa  50.1  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  30.4 
 
 
431 aa  50.1  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  40.48 
 
 
2178 aa  49.7  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  30.09 
 
 
457 aa  49.3  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  25.6 
 
 
765 aa  49.3  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  36.36 
 
 
419 aa  48.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  31.75 
 
 
448 aa  48.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.29 
 
 
418 aa  46.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.29 
 
 
418 aa  46.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>