More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2086 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  100 
 
 		 431 aa  875    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  67.48 
 
 		 419 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  54.67 
 
 		 409 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  53.79 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  53.79 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  53.79 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  52.91 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  54.35 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  54.84 
 
 		 402 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  51.73 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  54.84 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  52.72 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  54.76 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  49.86 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  51.68 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  47.04 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  46.39 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.99 
 
 		 425 aa  364  1e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  45.61 
 
 		 431 aa  361  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  48.31 
 
 		 451 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  48.6 
 
 		 423 aa  359  6e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  48.68 
 
 		 427 aa  358  8e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  46.9 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  48.67 
 
 		 449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  48.4 
 
 		 445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.3 
 
 		 451 aa  356  5e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  45.45 
 
 		 440 aa  356  5.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  48.77 
 
 		 428 aa  355  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  48.75 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  48.2 
 
 		 425 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  48.77 
 
 		 428 aa  355  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.07 
 
 		 414 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  45.7 
 
 		 431 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  44.47 
 
 		 414 aa  350  4e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  47.91 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  49.85 
 
 		 427 aa  346  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  46.94 
 
 		 448 aa  345  8.999999999999999e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.74 
 
 		 415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  45.82 
 
 		 453 aa  342  9e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  44.86 
 
 		 457 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  47.41 
 
 		 457 aa  334  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  49.25 
 
 		 405 aa  330  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.27 
 
 		 456 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.41 
 
 		 430 aa  325  7e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  42.65 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  41.71 
 
 		 445 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  43.8 
 
 		 420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  42.08 
 
 		 425 aa  299  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  38.96 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  38.12 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  36.13 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.93 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  34.84 
 
 		 372 aa  156  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  32.93 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.94 
 
 		 400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  32.28 
 
 		 369 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  32.44 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.56 
 
 		 453 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  33.23 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  30.41 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  32.81 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.04 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  30.7 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.5 
 
 		 411 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.93 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  29.95 
 
 		 401 aa  126  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  29.88 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  30.81 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  29.88 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  33.33 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 349 aa  123  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  31.69 
 
 		 361 aa  123  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.64 
 
 		 465 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.63 
 
 		 409 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  29.19 
 
 		 866 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  31.25 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  30.06 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  30.88 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  30.23 
 
 		 405 aa  117  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  30.23 
 
 		 405 aa  117  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  30.03 
 
 		 403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  31.48 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.43 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.48 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  30.51 
 
 		 426 aa  113  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.35 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  28.88 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  29.38 
 
 		 891 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  29.94 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  29.88 
 
 		 407 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  30.03 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  27.64 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.98 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  27.41 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.85 
 
 		 508 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.42 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  31.33 
 
 		 531 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 		 401 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  26.38 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  29.8 
 
 		 501 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>