220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2438 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  70.76 
 
 		 448 aa  662    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  72.65 
 
 		 443 aa  675    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  100 
 
 		 457 aa  944    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  81.44 
 
 		 457 aa  769    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  64.3 
 
 		 449 aa  592  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  65.08 
 
 		 451 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  65.36 
 
 		 449 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  65.93 
 
 		 445 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  62.58 
 
 		 451 aa  585  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  51.26 
 
 		 440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  50.76 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  50.13 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  48.94 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  52.36 
 
 		 437 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  47.94 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  47.56 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.55 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  49.48 
 
 		 409 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  45.1 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.48 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.48 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  46.12 
 
 		 418 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.45 
 
 		 414 aa  361  1e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  49.48 
 
 		 419 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  47.46 
 
 		 424 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  48.25 
 
 		 406 aa  352  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  48.25 
 
 		 402 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  46.97 
 
 		 406 aa  349  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  44.65 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.69 
 
 		 430 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  45.18 
 
 		 420 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  47.27 
 
 		 423 aa  346  6e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  44.62 
 
 		 437 aa  340  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  47.06 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.23 
 
 		 425 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  44.33 
 
 		 425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  44.47 
 
 		 431 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  41.29 
 
 		 419 aa  325  9e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  45.33 
 
 		 414 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  41.61 
 
 		 427 aa  319  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  39.49 
 
 		 445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  42.82 
 
 		 431 aa  300  5e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  41.37 
 
 		 428 aa  295  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  41.37 
 
 		 428 aa  295  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.67 
 
 		 415 aa  280  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  43.95 
 
 		 414 aa  275  9e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  43.11 
 
 		 405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  40.7 
 
 		 414 aa  264  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  32.29 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  33.11 
 
 		 376 aa  136  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  30.81 
 
 		 866 aa  129  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  28.66 
 
 		 369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.49 
 
 		 416 aa  113  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  28.49 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.86 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.16 
 
 		 400 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.88 
 
 		 415 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  28.35 
 
 		 369 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  27.88 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  32.92 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  31.32 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  29.39 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.25 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  28.01 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  31.5 
 
 		 402 aa  106  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  31.5 
 
 		 403 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  28.75 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  31.67 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  29.07 
 
 		 369 aa  104  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  29.3 
 
 		 402 aa  103  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  28.29 
 
 		 407 aa  103  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  27.75 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  30.14 
 
 		 420 aa  100  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  31.23 
 
 		 414 aa  100  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  26.11 
 
 		 412 aa  99  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  28.31 
 
 		 451 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  31.09 
 
 		 359 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  28.42 
 
 		 409 aa  95.9  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.38 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  31.02 
 
 		 426 aa  95.5  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  27.94 
 
 		 891 aa  95.5  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  30.65 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.95 
 
 		 453 aa  94  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  30.71 
 
 		 405 aa  93.6  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  30.71 
 
 		 405 aa  93.6  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  26.39 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  27.27 
 
 		 338 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  27.22 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  28.89 
 
 		 406 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  29.39 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  27.86 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.04 
 
 		 415 aa  92.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  27.37 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  27.58 
 
 		 363 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.47 
 
 		 335 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  30.36 
 
 		 410 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.08 
 
 		 501 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  29.33 
 
 		 417 aa  89.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.32 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.15 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>