More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1665 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  70.67 
 
 
448 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  70.6 
 
 
449 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  96.23 
 
 
451 aa  843    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
449 aa  916    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  69.76 
 
 
451 aa  663    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  97.55 
 
 
445 aa  838    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  68.09 
 
 
443 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  66.96 
 
 
457 aa  610  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  65.8 
 
 
457 aa  587  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  52.2 
 
 
431 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  55.79 
 
 
437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  54.15 
 
 
425 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  53.89 
 
 
425 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  55.36 
 
 
427 aa  438  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  54.43 
 
 
440 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  52.84 
 
 
430 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  49.54 
 
 
453 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  55.35 
 
 
409 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  51.48 
 
 
406 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.73 
 
 
414 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.99 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  52.33 
 
 
424 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.07 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.07 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  50.47 
 
 
418 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  53.52 
 
 
419 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  51.16 
 
 
420 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.58 
 
 
430 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  50.51 
 
 
425 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  48.66 
 
 
437 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  52.37 
 
 
406 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  52.37 
 
 
402 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  50.27 
 
 
423 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  50.4 
 
 
414 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  46.5 
 
 
425 aa  375  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  50.13 
 
 
429 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  45.96 
 
 
419 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.48 
 
 
425 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  46.99 
 
 
431 aa  361  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  43.59 
 
 
445 aa  354  1e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  46.43 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  46.43 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.94 
 
 
415 aa  327  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  45.88 
 
 
431 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  43.26 
 
 
414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  40.65 
 
 
427 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  43.98 
 
 
405 aa  299  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  41.75 
 
 
414 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  37.92 
 
 
376 aa  152  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  33.14 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.58 
 
 
412 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  32.91 
 
 
414 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  33.01 
 
 
866 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  32.7 
 
 
414 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  32.04 
 
 
420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  30.86 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.72 
 
 
415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  30.84 
 
 
403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  31.07 
 
 
402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.46 
 
 
434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  29.06 
 
 
451 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  32.25 
 
 
361 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.87 
 
 
400 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.54 
 
 
411 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  30.45 
 
 
369 aa  112  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.39 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.36 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.39 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  28.75 
 
 
414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  29.94 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.32 
 
 
416 aa  110  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.68 
 
 
416 aa  110  6e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.82 
 
 
410 aa  110  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  32.12 
 
 
359 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  30.75 
 
 
403 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  30.75 
 
 
402 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.36 
 
 
401 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  28.06 
 
 
407 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  31.04 
 
 
401 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  29.34 
 
 
408 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  29.77 
 
 
446 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  28.82 
 
 
369 aa  107  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  28.12 
 
 
369 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  28.65 
 
 
369 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.14 
 
 
408 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  26.62 
 
 
410 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  32.24 
 
 
338 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.12 
 
 
400 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  28.14 
 
 
408 aa  104  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.65 
 
 
465 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  29.17 
 
 
406 aa  103  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  28.36 
 
 
402 aa  103  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 
426 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.24 
 
 
408 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.97 
 
 
453 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  27.94 
 
 
409 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  29.93 
 
 
457 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  29.5 
 
 
407 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.28 
 
 
417 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.94 
 
 
408 aa  99.8  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>