More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3394 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  81.59 
 
 		 400 aa  688    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 402 aa  825    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  67.56 
 
 		 405 aa  568  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  67.56 
 
 		 405 aa  568  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  65.76 
 
 		 403 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  66.17 
 
 		 402 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  67 
 
 		 401 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  65.42 
 
 		 401 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  63.52 
 
 		 403 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  66.26 
 
 		 406 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  64.96 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  62.03 
 
 		 410 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  62.77 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.71 
 
 		 408 aa  465  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.55 
 
 		 406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  62.29 
 
 		 379 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  53.35 
 
 		 414 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  54.42 
 
 		 414 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  52.17 
 
 		 446 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  54.06 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.08 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  48.14 
 
 		 412 aa  349  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  41.65 
 
 		 412 aa  319  6e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  45.58 
 
 		 434 aa  302  7.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  43.78 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  34.6 
 
 		 409 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  35.26 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  31.91 
 
 		 451 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  34.02 
 
 		 369 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  34.6 
 
 		 369 aa  180  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  34.35 
 
 		 370 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  33.14 
 
 		 369 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  32.54 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  33.04 
 
 		 369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.07 
 
 		 453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  33.79 
 
 		 361 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  34.73 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  34.33 
 
 		 406 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  33.25 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  30.32 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.68 
 
 		 412 aa  160  5e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.68 
 
 		 412 aa  160  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.83 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  31.91 
 
 		 461 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  32.18 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.95 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  31.74 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.07 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.14 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  33.61 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 		 457 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  32.48 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  30.79 
 
 		 408 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  31.52 
 
 		 367 aa  143  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.95 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.39 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 431 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  32.17 
 
 		 430 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.82 
 
 		 400 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  32.4 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  32.09 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  30.89 
 
 		 407 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.89 
 
 		 408 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  31.33 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  33.43 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  32.06 
 
 		 407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.58 
 
 		 408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.18 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  30.58 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  31.25 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  30.23 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  33.44 
 
 		 542 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  30.48 
 
 		 427 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  31.09 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  29.91 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 		 414 aa  126  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  30.57 
 
 		 437 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  30.88 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.13 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  27.96 
 
 		 428 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  27.96 
 
 		 428 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.67 
 
 		 521 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.09 
 
 		 415 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  29.34 
 
 		 419 aa  123  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  31.16 
 
 		 534 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.43 
 
 		 501 aa  123  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  29.17 
 
 		 423 aa  120  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  31.43 
 
 		 406 aa  120  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  27.83 
 
 		 405 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  31.56 
 
 		 501 aa  119  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.43 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.96 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  31.39 
 
 		 546 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.97 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  27.56 
 
 		 420 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  28.31 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.52 
 
 		 508 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  27.47 
 
 		 419 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.17 
 
 		 509 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>