More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0949 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  100 
 
 
412 aa  820    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  64.44 
 
 
407 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  58.65 
 
 
446 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  56.3 
 
 
414 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  52.5 
 
 
417 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.11 
 
 
416 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  52.42 
 
 
401 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  51.36 
 
 
403 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  49.63 
 
 
410 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  50 
 
 
401 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  52.31 
 
 
402 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  50.25 
 
 
405 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  50.25 
 
 
405 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  48.89 
 
 
406 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.88 
 
 
400 aa  364  1e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  48.28 
 
 
403 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  47.51 
 
 
402 aa  354  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.47 
 
 
406 aa  345  7e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  50.14 
 
 
402 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.85 
 
 
408 aa  327  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  42.72 
 
 
414 aa  325  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  56.52 
 
 
379 aa  319  7e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  46.43 
 
 
426 aa  301  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  36.06 
 
 
412 aa  296  4e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  41.55 
 
 
434 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  40.36 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  33.61 
 
 
451 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  31.25 
 
 
410 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.13 
 
 
417 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  33.25 
 
 
409 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  35.36 
 
 
372 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  31.16 
 
 
457 aa  167  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  32.76 
 
 
420 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  32.39 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  32.39 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.75 
 
 
453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.4 
 
 
411 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  32.07 
 
 
461 aa  159  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.61 
 
 
416 aa  159  7e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.04 
 
 
412 aa  159  9e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.04 
 
 
412 aa  159  9e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  32.58 
 
 
461 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  32.55 
 
 
369 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.51 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.47 
 
 
408 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  34.6 
 
 
361 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.71 
 
 
408 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.52 
 
 
406 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  29.47 
 
 
408 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  35.63 
 
 
414 aa  149  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  29.86 
 
 
369 aa  149  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  30.64 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  35.07 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  30.32 
 
 
369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  33.06 
 
 
359 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  28.9 
 
 
363 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  30.64 
 
 
407 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.24 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  31.31 
 
 
431 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.93 
 
 
415 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.84 
 
 
400 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  29.64 
 
 
409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.57 
 
 
501 aa  136  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  32.82 
 
 
418 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.31 
 
 
418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.29 
 
 
376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.31 
 
 
418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  33.23 
 
 
427 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  31.81 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.3 
 
 
501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  33.14 
 
 
451 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  34.77 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  32.58 
 
 
449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  32.29 
 
 
445 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.88 
 
 
409 aa  126  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  30.75 
 
 
425 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.09 
 
 
335 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  32.27 
 
 
407 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.92 
 
 
415 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  31.4 
 
 
866 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  30.12 
 
 
425 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  29.34 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  27.75 
 
 
600 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  30.4 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  29.35 
 
 
457 aa  116  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  29.25 
 
 
431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  33.44 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  33.44 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  30.61 
 
 
423 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  29.03 
 
 
349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  29.6 
 
 
406 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  32.9 
 
 
534 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  29.28 
 
 
453 aa  112  9e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  30.65 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  30.97 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  30.97 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  30.86 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30 
 
 
509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.48 
 
 
414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  29 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>