More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5892 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
335 aa  678    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  45.96 
 
 
349 aa  262  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  42.36 
 
 
338 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  32.87 
 
 
372 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  31.95 
 
 
407 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  32.9 
 
 
369 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  33.88 
 
 
414 aa  125  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.09 
 
 
412 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  31.53 
 
 
409 aa  123  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.55 
 
 
434 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.85 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  33.23 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.03 
 
 
453 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  29.81 
 
 
446 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  29.68 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  31.51 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.44 
 
 
501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  29.39 
 
 
429 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  34.26 
 
 
428 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  34.26 
 
 
428 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  32.3 
 
 
401 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  32.01 
 
 
370 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  28.71 
 
 
437 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.16 
 
 
418 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.16 
 
 
418 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  26.88 
 
 
412 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.21 
 
 
416 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  30.33 
 
 
414 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  34.19 
 
 
554 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  29.76 
 
 
409 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  28.98 
 
 
414 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.23 
 
 
400 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  31.71 
 
 
359 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  29.75 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  34.41 
 
 
570 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  27.85 
 
 
414 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  29.81 
 
 
419 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  28.39 
 
 
369 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  29.75 
 
 
461 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  31.6 
 
 
407 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  29.75 
 
 
461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  30.93 
 
 
406 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  28.08 
 
 
410 aa  109  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.93 
 
 
402 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.09 
 
 
430 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  30.34 
 
 
431 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  30.64 
 
 
406 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  29.78 
 
 
424 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  29.41 
 
 
406 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.36 
 
 
406 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  32.19 
 
 
405 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  32.19 
 
 
405 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  28.34 
 
 
369 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  29.6 
 
 
457 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.74 
 
 
411 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  31 
 
 
505 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  31.4 
 
 
419 aa  106  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  27.19 
 
 
420 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  29.14 
 
 
367 aa  105  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  30.06 
 
 
448 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.97 
 
 
417 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  28.48 
 
 
437 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  29.77 
 
 
402 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  31.34 
 
 
420 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  27.74 
 
 
405 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  27.16 
 
 
451 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  31.49 
 
 
401 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.74 
 
 
207 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.65 
 
 
505 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.39 
 
 
509 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  28.71 
 
 
410 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  30.38 
 
 
426 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  31.58 
 
 
512 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.37 
 
 
525 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.58 
 
 
512 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.58 
 
 
512 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01006  Nitrate reductase [NADPH] (NR)(EC 1.7.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22945]  26.33 
 
 
873 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.45 
 
 
508 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.72 
 
 
465 aa  99.8  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  33 
 
 
538 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.43 
 
 
400 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.23 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.95 
 
 
417 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  28.98 
 
 
449 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  28.98 
 
 
445 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.53 
 
 
415 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  28.98 
 
 
451 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 
425 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  29.58 
 
 
417 aa  96.3  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  31.16 
 
 
402 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  26.93 
 
 
363 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.08 
 
 
508 aa  96.3  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  31.16 
 
 
403 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  29.35 
 
 
408 aa  95.9  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  26.58 
 
 
445 aa  95.9  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  30.1 
 
 
402 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.86 
 
 
425 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  29.69 
 
 
408 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.67 
 
 
408 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  27.13 
 
 
431 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>