More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3951 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  100 
 
 		 369 aa  753    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  74.53 
 
 		 372 aa  560  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  59.66 
 
 		 414 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  57.71 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.43 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  37.09 
 
 		 369 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  36.2 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  36.39 
 
 		 369 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.68 
 
 		 415 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  37.85 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  34.38 
 
 		 451 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  38.4 
 
 		 359 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.67 
 
 		 453 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  38.84 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  29.18 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  37.01 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  35.76 
 
 		 361 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  34.6 
 
 		 402 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  35.94 
 
 		 406 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  36.34 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  36.34 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 426 aa  176  8e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  36.45 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  36.67 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  36.67 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  34.39 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.34 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  32.2 
 
 		 363 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.63 
 
 		 400 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.33 
 
 		 415 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  35.36 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  35.46 
 
 		 401 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.91 
 
 		 416 aa  166  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 407 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.03 
 
 		 414 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  35.61 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  35.61 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  36.13 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  34.38 
 
 		 410 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  34.36 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  33.14 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  33.64 
 
 		 431 aa  159  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  32.7 
 
 		 866 aa  159  8e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.35 
 
 		 411 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  34.18 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.01 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  32.82 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.94 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.55 
 
 		 406 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.55 
 
 		 501 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  32.08 
 
 		 414 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  31.99 
 
 		 461 aa  152  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  31.7 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  34.83 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  31.38 
 
 		 405 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.26 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  30.2 
 
 		 410 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.52 
 
 		 417 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  33.44 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  35.28 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  33.97 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  29.13 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.31 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  33.97 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  32.29 
 
 		 425 aa  143  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  33.54 
 
 		 453 aa  143  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  29.67 
 
 		 427 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.97 
 
 		 415 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  32.9 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  32.3 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  32.36 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  31.87 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  32.08 
 
 		 891 aa  140  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  33.23 
 
 		 440 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  31.74 
 
 		 408 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  33.23 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.13 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.42 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.23 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.42 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  31.68 
 
 		 420 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  32.22 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  31.19 
 
 		 437 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.53 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  33.95 
 
 		 407 aa  132  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.9 
 
 		 335 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  34.92 
 
 		 534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 431 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.89 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.53 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.45 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  29.67 
 
 		 446 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  32.04 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  33.65 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  29.34 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  30.41 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  31.58 
 
 		 417 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  31.96 
 
 		 425 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  33.1 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  32.14 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>