276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3041 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
414 aa  856    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  64.22 
 
 
437 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  58.22 
 
 
427 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  53.83 
 
 
430 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  49.41 
 
 
445 aa  429  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  53.83 
 
 
453 aa  422  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  50.74 
 
 
431 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  50.93 
 
 
425 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  51.66 
 
 
440 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  50.93 
 
 
425 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  52.38 
 
 
420 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.62 
 
 
456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  52.38 
 
 
449 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  51.72 
 
 
445 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  51.98 
 
 
451 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.45 
 
 
451 aa  394  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  51.45 
 
 
449 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  49.62 
 
 
448 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.11 
 
 
430 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  47.16 
 
 
425 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  49.01 
 
 
406 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  48.43 
 
 
418 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  50.13 
 
 
429 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  50.4 
 
 
414 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  49.87 
 
 
425 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.18 
 
 
418 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.18 
 
 
418 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  51.07 
 
 
409 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  49.5 
 
 
424 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  50.79 
 
 
419 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  46.72 
 
 
431 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  47.18 
 
 
437 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.41 
 
 
425 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  49.47 
 
 
402 aa  363  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  49.74 
 
 
457 aa  363  4e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  49.2 
 
 
406 aa  362  6e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  48.56 
 
 
443 aa  361  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  48.3 
 
 
457 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  47.52 
 
 
423 aa  354  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  45.08 
 
 
419 aa  351  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  43.8 
 
 
428 aa  349  5e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  43.8 
 
 
428 aa  349  5e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  48.42 
 
 
431 aa  345  6e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.49 
 
 
415 aa  323  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  43.1 
 
 
414 aa  315  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  42.75 
 
 
414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  41.79 
 
 
405 aa  305  9.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  40.15 
 
 
427 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.64 
 
 
400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  35.65 
 
 
370 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  34.88 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.51 
 
 
415 aa  152  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  31.56 
 
 
372 aa  144  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  30.52 
 
 
369 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  31.45 
 
 
369 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  31.11 
 
 
414 aa  130  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  29.49 
 
 
369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  29.22 
 
 
420 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  28.98 
 
 
369 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30 
 
 
415 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  31.52 
 
 
451 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  29.75 
 
 
461 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  29.43 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  25.87 
 
 
409 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.72 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  30.12 
 
 
401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  28.27 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  29.32 
 
 
414 aa  113  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  29.45 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  29.45 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  30.6 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.48 
 
 
412 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.48 
 
 
453 aa  110  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  28.53 
 
 
406 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.6 
 
 
408 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.84 
 
 
465 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.75 
 
 
411 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  34.22 
 
 
401 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  25.92 
 
 
410 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  28.2 
 
 
402 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  30.7 
 
 
407 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  31.5 
 
 
403 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.06 
 
 
417 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.36 
 
 
417 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.52 
 
 
406 aa  106  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  28.46 
 
 
434 aa  106  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  32 
 
 
426 aa  106  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  28.39 
 
 
405 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  29.47 
 
 
417 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  28.73 
 
 
361 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  30.33 
 
 
338 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  28.27 
 
 
405 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  28.27 
 
 
405 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  29.55 
 
 
349 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  33.16 
 
 
407 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3554  predicted protein  27.69 
 
 
375 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298587  normal  0.425378 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  29.48 
 
 
409 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  31.52 
 
 
379 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.76 
 
 
406 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.48 
 
 
409 aa  100  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>