More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4627 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
414 aa  852    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  60.59 
 
 
446 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  58.09 
 
 
407 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  56.3 
 
 
412 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  54.3 
 
 
405 aa  421  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  54.3 
 
 
405 aa  421  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  53.7 
 
 
416 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  53.62 
 
 
401 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  55.8 
 
 
406 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  52.97 
 
 
410 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  53.17 
 
 
401 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  52.46 
 
 
403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  53.62 
 
 
417 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  54.42 
 
 
402 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  51.97 
 
 
402 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  52.48 
 
 
403 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.1 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.89 
 
 
406 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  50.54 
 
 
402 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  44.74 
 
 
414 aa  363  3e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.63 
 
 
408 aa  358  7e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  47.37 
 
 
412 aa  350  3e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  52.12 
 
 
379 aa  344  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  45.38 
 
 
426 aa  311  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  42.97 
 
 
434 aa  270  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  32.81 
 
 
410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  32.01 
 
 
451 aa  193  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
369 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  34.46 
 
 
420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  30.66 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.41 
 
 
417 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  32.21 
 
 
369 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  37.36 
 
 
361 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  36.98 
 
 
370 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  32.75 
 
 
369 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.62 
 
 
453 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.29 
 
 
416 aa  177  4e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.87 
 
 
411 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  30.84 
 
 
408 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.05 
 
 
412 aa  176  9e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.05 
 
 
412 aa  176  9e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  31.38 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  31.19 
 
 
409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  31.15 
 
 
461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  34.87 
 
 
372 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  35.12 
 
 
369 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  30.36 
 
 
408 aa  167  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  30.75 
 
 
408 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.45 
 
 
408 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.45 
 
 
408 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  34.72 
 
 
414 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.94 
 
 
408 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  33.23 
 
 
417 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  32.36 
 
 
407 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 
415 aa  160  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  33.6 
 
 
359 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.04 
 
 
406 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.34 
 
 
400 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  29.57 
 
 
363 aa  152  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  32.57 
 
 
409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  29.74 
 
 
407 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  32.15 
 
 
367 aa  142  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  30.15 
 
 
1016 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.19 
 
 
376 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  30.64 
 
 
431 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.12 
 
 
409 aa  136  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  31.28 
 
 
349 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  32.09 
 
 
425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  32.81 
 
 
440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.69 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.08 
 
 
501 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  29.08 
 
 
380 aa  130  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  31.86 
 
 
430 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.88 
 
 
415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  32.8 
 
 
423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  33.23 
 
 
451 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  32.91 
 
 
449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  33.23 
 
 
445 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  30.06 
 
 
453 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  31.73 
 
 
409 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  32.8 
 
 
406 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  31.21 
 
 
427 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  32.8 
 
 
402 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  30.72 
 
 
425 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  30.99 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  30.96 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  29.44 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.52 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.52 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  31.09 
 
 
414 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.74 
 
 
415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  27.59 
 
 
600 aa  120  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  29.71 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  30.52 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  32.08 
 
 
429 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  30.06 
 
 
431 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  31.46 
 
 
428 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  31.46 
 
 
428 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  30.28 
 
 
419 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  31.35 
 
 
414 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>