More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0911 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  100 
 
 		 437 aa  906    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  68.15 
 
 		 423 aa  578  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  54.19 
 
 		 409 aa  425  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  57.31 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  57.31 
 
 		 402 aa  401  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  50.5 
 
 		 406 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  52.62 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  51.93 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  51.04 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  45.73 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  49.75 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  50.85 
 
 		 418 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  46.95 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.61 
 
 		 418 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.61 
 
 		 418 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  48.68 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.33 
 
 		 425 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  46.1 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  47.42 
 
 		 427 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  48.8 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  48.66 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  48.67 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.72 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  48.66 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  49.36 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  48 
 
 		 451 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  47.59 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  47.47 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  47.72 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  47.13 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  43.41 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.14 
 
 		 415 aa  364  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.89 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  45.58 
 
 		 448 aa  358  8e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  47.15 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.64 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  46.77 
 
 		 457 aa  352  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  45.61 
 
 		 414 aa  350  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  46.81 
 
 		 405 aa  351  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  44.12 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  43.75 
 
 		 457 aa  346  5e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  44.5 
 
 		 428 aa  345  8e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  44.5 
 
 		 428 aa  345  8e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  40.43 
 
 		 445 aa  342  5.999999999999999e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.47 
 
 		 430 aa  341  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  49.09 
 
 		 414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  44.36 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  42.24 
 
 		 427 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  33.23 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  32.49 
 
 		 409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.45 
 
 		 415 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  31.95 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  29.88 
 
 		 461 aa  143  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  29.88 
 
 		 461 aa  143  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  30.54 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.89 
 
 		 400 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  30.4 
 
 		 414 aa  140  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  31.76 
 
 		 420 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.51 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  31.05 
 
 		 410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  30.79 
 
 		 349 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  31.19 
 
 		 369 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  29.36 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  31.05 
 
 		 338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  28.97 
 
 		 451 aa  126  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  30.19 
 
 		 361 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.65 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  29.89 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  29.11 
 
 		 402 aa  123  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  29.11 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.61 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  29.13 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  27.48 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  27.48 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.38 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.51 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  29.36 
 
 		 369 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  27.36 
 
 		 363 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  32.12 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  30.8 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  29.14 
 
 		 369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  30.03 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.4 
 
 		 335 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  29.38 
 
 		 408 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  29.5 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  27.59 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  28.99 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.03 
 
 		 417 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.87 
 
 		 409 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.41 
 
 		 501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.39 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  29.87 
 
 		 417 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.31 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.39 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  28.7 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  30.14 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  28.36 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  28.99 
 
 		 866 aa  108  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  27.01 
 
 		 406 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  28.3 
 
 		 406 aa  107  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>