More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3407 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  81.25 
 
 
531 aa  781    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  81.25 
 
 
528 aa  780    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
525 aa  1045    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  47.93 
 
 
554 aa  473  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.55 
 
 
511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  50.5 
 
 
524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  48.94 
 
 
570 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.59 
 
 
505 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  49.22 
 
 
523 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.29 
 
 
512 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.3 
 
 
505 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.44 
 
 
531 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.57 
 
 
509 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  46.82 
 
 
512 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.82 
 
 
512 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.82 
 
 
512 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.64 
 
 
508 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.18 
 
 
520 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.26 
 
 
545 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  43.78 
 
 
534 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  49.12 
 
 
531 aa  405  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  49.2 
 
 
538 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  43.81 
 
 
546 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.9 
 
 
515 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  45.62 
 
 
488 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  41.1 
 
 
542 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.88 
 
 
521 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  56.09 
 
 
532 aa  361  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.58 
 
 
508 aa  359  9e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  49.44 
 
 
608 aa  349  6e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.95 
 
 
552 aa  300  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  44.9 
 
 
501 aa  276  8e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.85 
 
 
501 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  35.87 
 
 
505 aa  200  6e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  34.81 
 
 
489 aa  192  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.02 
 
 
512 aa  180  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.12 
 
 
465 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.43 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  33.23 
 
 
403 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  31.83 
 
 
401 aa  118  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  31.79 
 
 
372 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  31.31 
 
 
369 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.32 
 
 
200 aa  116  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.29 
 
 
415 aa  113  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  31.23 
 
 
402 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  31.23 
 
 
403 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 
199 aa  111  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  29.1 
 
 
369 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.14 
 
 
209 aa  110  8.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  31.68 
 
 
229 aa  109  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.94 
 
 
415 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  30.99 
 
 
405 aa  107  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  30.99 
 
 
405 aa  107  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  29.58 
 
 
370 aa  106  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  31.72 
 
 
402 aa  106  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  32.3 
 
 
402 aa  106  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.07 
 
 
400 aa  105  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  28.53 
 
 
369 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  31.96 
 
 
429 aa  104  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  31.76 
 
 
409 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  29.45 
 
 
420 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  30.13 
 
 
414 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  28.08 
 
 
431 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.37 
 
 
335 aa  101  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  29.66 
 
 
406 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  30 
 
 
367 aa  100  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.91 
 
 
408 aa  100  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  29.18 
 
 
401 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  33.18 
 
 
231 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  33.64 
 
 
231 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.52 
 
 
400 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  30.36 
 
 
414 aa  98.6  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  27.4 
 
 
369 aa  97.1  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  28.89 
 
 
406 aa  96.3  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  29.62 
 
 
417 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  28.81 
 
 
338 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.38 
 
 
434 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  27.24 
 
 
437 aa  95.5  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  32.73 
 
 
231 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  29.79 
 
 
423 aa  94.7  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  29.15 
 
 
426 aa  94.4  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  34.48 
 
 
270 aa  94  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  30.09 
 
 
407 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.03 
 
 
207 aa  93.6  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  28.91 
 
 
361 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  25.26 
 
 
427 aa  93.6  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  28.71 
 
 
431 aa  93.2  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.27 
 
 
221 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  30.79 
 
 
446 aa  91.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  35.29 
 
 
205 aa  91.3  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  30.98 
 
 
430 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1452  oxidoreductase molybdopterin binding  28.24 
 
 
309 aa  90.9  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952926  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  34.94 
 
 
199 aa  90.5  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  30.84 
 
 
406 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.12 
 
 
406 aa  90.1  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  29.55 
 
 
414 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.84 
 
 
402 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.63 
 
 
416 aa  90.1  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  25.24 
 
 
363 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  28.48 
 
 
409 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>