More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2981 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  100 
 
 
420 aa  860    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  51.6 
 
 
417 aa  421  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  51.36 
 
 
457 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  50 
 
 
410 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  48.61 
 
 
461 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  48.84 
 
 
461 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.74 
 
 
411 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.91 
 
 
453 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  46.54 
 
 
451 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.83 
 
 
416 aa  354  1e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  47.07 
 
 
408 aa  352  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  47.07 
 
 
408 aa  347  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.33 
 
 
412 aa  345  8e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.33 
 
 
412 aa  345  8e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  45.61 
 
 
408 aa  333  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.9 
 
 
408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.15 
 
 
408 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  44.15 
 
 
408 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  35.32 
 
 
409 aa  208  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  38.5 
 
 
361 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  33.25 
 
 
412 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  35.42 
 
 
410 aa  193  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  36.08 
 
 
417 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  36.81 
 
 
359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  33.92 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  34.22 
 
 
446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  34.43 
 
 
406 aa  182  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  33.02 
 
 
405 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  33.02 
 
 
405 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  35.81 
 
 
367 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
426 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  35.25 
 
 
414 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  37.09 
 
 
414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.06 
 
 
416 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  35.73 
 
 
401 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.23 
 
 
414 aa  172  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  33.83 
 
 
401 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  32.94 
 
 
369 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  32.75 
 
 
369 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
369 aa  167  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  34.27 
 
 
402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  34.65 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  34.1 
 
 
370 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.82 
 
 
415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  32.78 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  33.91 
 
 
403 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  29.95 
 
 
363 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.09 
 
 
400 aa  163  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.92 
 
 
406 aa  162  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.15 
 
 
434 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.92 
 
 
408 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.89 
 
 
412 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  33.14 
 
 
369 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  33.25 
 
 
402 aa  159  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  32.13 
 
 
428 aa  159  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  32.13 
 
 
428 aa  159  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  32.32 
 
 
414 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  33.33 
 
 
407 aa  156  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  34.62 
 
 
379 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  34.74 
 
 
409 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  32.34 
 
 
417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  35.99 
 
 
409 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  31.16 
 
 
431 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  33.5 
 
 
407 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  33.07 
 
 
405 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  35.4 
 
 
419 aa  150  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  34.12 
 
 
406 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.78 
 
 
376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  34.47 
 
 
429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  34.83 
 
 
427 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  34.71 
 
 
440 aa  146  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.93 
 
 
415 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.62 
 
 
409 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  32.93 
 
 
414 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  30.46 
 
 
372 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  34.91 
 
 
349 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  33.8 
 
 
431 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  34.4 
 
 
406 aa  143  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  32.21 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  34.11 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.8 
 
 
501 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  35.19 
 
 
425 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  32.44 
 
 
431 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  35.19 
 
 
425 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.16 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  31.76 
 
 
437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  34.97 
 
 
437 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  28.65 
 
 
1016 aa  136  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  31.17 
 
 
445 aa  136  8e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.83 
 
 
400 aa  136  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  33.23 
 
 
425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.82 
 
 
405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  32.67 
 
 
414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  33.13 
 
 
419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.06 
 
 
425 aa  131  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  32.09 
 
 
424 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  34.4 
 
 
420 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  32.94 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.22 
 
 
414 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>