More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1107 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
207 aa  419  1e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  65.07 
 
 
209 aa  267  8.999999999999999e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  54.34 
 
 
270 aa  188  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  36.61 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  35.52 
 
 
231 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  35.52 
 
 
231 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.05 
 
 
230 aa  121  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.67 
 
 
501 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2409  oxidoreductase molybdopterin binding  37.42 
 
 
230 aa  118  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00600031  normal  0.457141 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.6 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  35 
 
 
374 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  31.84 
 
 
231 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  31.46 
 
 
230 aa  111  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.43 
 
 
509 aa  111  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  30.95 
 
 
489 aa  109  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.57 
 
 
508 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.74 
 
 
335 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.67 
 
 
243 aa  101  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0237  oxidoreductase molybdopterin binding  30.92 
 
 
189 aa  101  8e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.164235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  30.25 
 
 
505 aa  100  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  34.48 
 
 
538 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1055  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.71 
 
 
202 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.25 
 
 
520 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.04 
 
 
531 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.32 
 
 
512 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  31.4 
 
 
531 aa  99  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.79 
 
 
515 aa  98.6  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  31.22 
 
 
431 aa  98.6  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.11 
 
 
200 aa  97.8  9e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.95 
 
 
501 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  32.04 
 
 
554 aa  95.9  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  33.97 
 
 
220 aa  95.9  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.18 
 
 
198 aa  95.5  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  29.55 
 
 
534 aa  94.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.21 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  29.31 
 
 
528 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.41 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  29.31 
 
 
531 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.03 
 
 
525 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  31.84 
 
 
523 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.75 
 
 
465 aa  94  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  30 
 
 
414 aa  92.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  33.56 
 
 
205 aa  92  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  28.5 
 
 
338 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  29.07 
 
 
524 aa  92  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  26.01 
 
 
528 aa  91.7  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2682  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.3 
 
 
199 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  29.94 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.71 
 
 
511 aa  90.1  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  31.03 
 
 
372 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.58 
 
 
532 aa  89.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.89 
 
 
237 aa  89.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  30.85 
 
 
428 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  30.85 
 
 
428 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  31.79 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.68 
 
 
229 aa  89.7  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.53 
 
 
508 aa  89.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  29.65 
 
 
570 aa  89  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.16 
 
 
505 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  34.44 
 
 
202 aa  88.6  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.74907  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  32.1 
 
 
201 aa  88.6  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  38.18 
 
 
234 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  28.16 
 
 
369 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  37.01 
 
 
256 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.87 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  28.18 
 
 
546 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.77 
 
 
512 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1452  oxidoreductase molybdopterin binding  33.14 
 
 
309 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952926  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.88 
 
 
230 aa  86.7  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.25 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  32.53 
 
 
349 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.36 
 
 
430 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  29.63 
 
 
229 aa  85.9  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.44 
 
 
545 aa  85.9  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  31.03 
 
 
370 aa  85.5  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.58 
 
 
505 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.61 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  26.6 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0323  oxidoreductase molybdopterin binding  30.92 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204614  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.11 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  27.13 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.15 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.74 
 
 
521 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.24 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.3 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1471  oxidoreductase molybdopterin binding  30.46 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000177918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3101  oxidoreductase molybdopterin binding  33.12 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  28.57 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  31.51 
 
 
430 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  26.63 
 
 
437 aa  81.6  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  26.74 
 
 
431 aa  81.6  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  28.99 
 
 
431 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.27 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  27.17 
 
 
429 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.48 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  30.29 
 
 
608 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  32.18 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  27.27 
 
 
542 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  26.52 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3045  oxidoreductase molybdopterin binding  30.49 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>