252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0055 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 		 417 aa  840    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  85.91 
 
 		 406 aa  648    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  72.22 
 
 		 409 aa  555  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  70.44 
 
 		 405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  57.66 
 
 		 409 aa  464  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  57 
 
 		 407 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  37.5 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  34.9 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.42 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  34.35 
 
 		 403 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  36.64 
 
 		 406 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.09 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  36.36 
 
 		 402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  34.77 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.89 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  32.8 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  32.8 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  35.46 
 
 		 426 aa  171  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  33.42 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  35.38 
 
 		 403 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.99 
 
 		 415 aa  169  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  34.57 
 
 		 405 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  34.57 
 
 		 405 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.8 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.28 
 
 		 400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  34.3 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.86 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  33.23 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.14 
 
 		 417 aa  156  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  33.06 
 
 		 361 aa  156  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.27 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  31.82 
 
 		 420 aa  155  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  32.51 
 
 		 410 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  31.09 
 
 		 412 aa  153  7e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  35.16 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.05 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  34.68 
 
 		 412 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  31.39 
 
 		 408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  32.65 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  30.64 
 
 		 408 aa  146  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.49 
 
 		 411 aa  145  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  33.04 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.74 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  33.83 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  33.43 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  29.71 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.65 
 
 		 416 aa  139  7e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.4 
 
 		 406 aa  136  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  31.44 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  30.36 
 
 		 369 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.18 
 
 		 412 aa  133  5e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.18 
 
 		 412 aa  133  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  29.98 
 
 		 407 aa  133  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  31.5 
 
 		 367 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  32.33 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.11 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.42 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.11 
 
 		 408 aa  131  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  30.65 
 
 		 369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  33.11 
 
 		 379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  31.58 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  33.87 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  31.5 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  29.45 
 
 		 414 aa  126  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  30.64 
 
 		 430 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  29.94 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  33.33 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  30.41 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  29.06 
 
 		 505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  29.5 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  33.44 
 
 		 406 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  29.92 
 
 		 600 aa  117  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  30.7 
 
 		 409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  31.42 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.42 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  27.53 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  29.88 
 
 		 427 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  30.49 
 
 		 427 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  33.73 
 
 		 419 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  27.42 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.94 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  30.43 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.82 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.82 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  30.09 
 
 		 349 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  31.43 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.37 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  27.33 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  29.77 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  31.17 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  32.06 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  29.59 
 
 		 501 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  28.22 
 
 		 440 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.47 
 
 		 414 aa  106  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  27.86 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  29.25 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  29.05 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  30.24 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.43 
 
 		 512 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>