298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3258 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  70.38 
 
 		 449 aa  634    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  70.25 
 
 		 448 aa  647    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  100 
 
 		 449 aa  923    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  73.39 
 
 		 451 aa  701    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  69.84 
 
 		 451 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  70.34 
 
 		 445 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  67.18 
 
 		 457 aa  615  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  69.53 
 
 		 443 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  64.52 
 
 		 457 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  52.09 
 
 		 431 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  51.79 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  55.38 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  54.36 
 
 		 425 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  54.1 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  52.74 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  53.44 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.76 
 
 		 418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.76 
 
 		 418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  54.55 
 
 		 409 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.48 
 
 		 414 aa  405  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  52.49 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  48.73 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  51.55 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.36 
 
 		 456 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  52.22 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.36 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  51.17 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  51.04 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  53.44 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  53.44 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  49.06 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  49.52 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  48.12 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  48.35 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  49.73 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  48.92 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  48.66 
 
 		 423 aa  361  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  49.33 
 
 		 414 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.13 
 
 		 425 aa  360  4e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  42.89 
 
 		 445 aa  342  5e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  43.86 
 
 		 431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  45.3 
 
 		 428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  45.3 
 
 		 428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  46.71 
 
 		 427 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.52 
 
 		 415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  44.38 
 
 		 414 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  44.38 
 
 		 405 aa  292  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  41.26 
 
 		 414 aa  288  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  32.95 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  35.88 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  29.75 
 
 		 369 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  31.6 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  31.51 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  29.65 
 
 		 369 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  29.91 
 
 		 369 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  32.39 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  30.15 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  31.92 
 
 		 361 aa  120  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.19 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.72 
 
 		 415 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.08 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  31.41 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  31.48 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  31.53 
 
 		 403 aa  113  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  30.72 
 
 		 866 aa  113  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  27.67 
 
 		 408 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  28.74 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.97 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  28.93 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  29.15 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.79 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  32.35 
 
 		 359 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  30.91 
 
 		 401 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  31.64 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  29.29 
 
 		 407 aa  108  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  28.53 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  31.17 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.11 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  28.09 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  31.86 
 
 		 402 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  31.86 
 
 		 403 aa  106  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  29.78 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  29.66 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  29.26 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  29.43 
 
 		 409 aa  104  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  30.35 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.82 
 
 		 411 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.65 
 
 		 453 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  29.26 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.1 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  29.26 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.56 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  29.26 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  29.05 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.84 
 
 		 409 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  29.09 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.71 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.87 
 
 		 416 aa  99.8  8e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  25.89 
 
 		 363 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.55 
 
 		 501 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>