More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2351 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  100 
 
 
376 aa  738    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.47 
 
 
415 aa  329  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.53 
 
 
400 aa  315  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  43.22 
 
 
369 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  43.69 
 
 
369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  42.27 
 
 
369 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  42.14 
 
 
370 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  39.83 
 
 
372 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  38.84 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  40.33 
 
 
414 aa  179  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  37.62 
 
 
431 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  41.06 
 
 
428 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  41.06 
 
 
428 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  38.71 
 
 
419 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  39.4 
 
 
430 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  40.2 
 
 
423 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  37.23 
 
 
409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  38.33 
 
 
431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  40.13 
 
 
429 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  38.96 
 
 
431 aa  172  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  37.21 
 
 
427 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  36.75 
 
 
425 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  38.41 
 
 
361 aa  169  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  37.67 
 
 
437 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  36.42 
 
 
425 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  34.68 
 
 
414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  37.99 
 
 
440 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  39.61 
 
 
414 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  34.04 
 
 
412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  35.18 
 
 
427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  34.82 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  37 
 
 
420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  37.25 
 
 
443 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.47 
 
 
425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.71 
 
 
453 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  35.85 
 
 
407 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  34.01 
 
 
453 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  35.88 
 
 
426 aa  159  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  35 
 
 
416 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  34.46 
 
 
425 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  38.41 
 
 
403 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  37.8 
 
 
401 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  38.33 
 
 
406 aa  157  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  38.41 
 
 
402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  38.33 
 
 
402 aa  156  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.88 
 
 
414 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.23 
 
 
415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  38.17 
 
 
359 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  34.42 
 
 
445 aa  153  5e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  38.26 
 
 
451 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  37.92 
 
 
445 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  37.38 
 
 
419 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.33 
 
 
418 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.33 
 
 
418 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  36.39 
 
 
403 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  37.92 
 
 
449 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  35.31 
 
 
448 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  36.72 
 
 
424 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.04 
 
 
406 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  37.34 
 
 
406 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  33.53 
 
 
409 aa  149  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  37 
 
 
418 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.1 
 
 
430 aa  149  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  33.23 
 
 
437 aa  149  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  35.78 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  32.83 
 
 
410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  34.12 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.32 
 
 
411 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
405 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  32.74 
 
 
417 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.14 
 
 
434 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  35.97 
 
 
457 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  35.82 
 
 
401 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  35.96 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  35.88 
 
 
449 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  36.12 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  35.19 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  35.14 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.24 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.67 
 
 
451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  35.54 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
407 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.87 
 
 
456 aa  138  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.55 
 
 
400 aa  137  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  35.03 
 
 
425 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  31.33 
 
 
402 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  33.11 
 
 
457 aa  136  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  35.29 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  31.29 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  31.29 
 
 
461 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  32.41 
 
 
407 aa  133  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.14 
 
 
405 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  33.33 
 
 
446 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  31.89 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.3 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  31.88 
 
 
531 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  31.88 
 
 
528 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  32.43 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  32.43 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  30.81 
 
 
457 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>