222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2728 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 		 409 aa  832    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  62.13 
 
 		 407 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  60.87 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  62.23 
 
 		 405 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  60.61 
 
 		 417 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  59.41 
 
 		 409 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  35.28 
 
 		 409 aa  189  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.82 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  34.38 
 
 		 402 aa  170  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  34.55 
 
 		 426 aa  167  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.2 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  32.38 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  32.01 
 
 		 401 aa  159  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  32.44 
 
 		 403 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  31.6 
 
 		 405 aa  159  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  31.6 
 
 		 405 aa  159  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  32.67 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  33.76 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.48 
 
 		 415 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.11 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.63 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  34.74 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.81 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.47 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  28.69 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  31.25 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  34.13 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  31.25 
 
 		 461 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  32.57 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.76 
 
 		 400 aa  146  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  31.71 
 
 		 406 aa  146  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  32.48 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  31.82 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.24 
 
 		 408 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.53 
 
 		 453 aa  143  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  30.23 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  30.49 
 
 		 361 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.04 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.82 
 
 		 411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.14 
 
 		 416 aa  140  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.22 
 
 		 410 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  31.64 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.52 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  31.43 
 
 		 408 aa  133  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  31.19 
 
 		 408 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  31.4 
 
 		 407 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  31.71 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  30.72 
 
 		 407 aa  127  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  30.34 
 
 		 446 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.31 
 
 		 376 aa  126  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  29.85 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.43 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  30.09 
 
 		 379 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  30.36 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  30.18 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  30.51 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.89 
 
 		 416 aa  117  5e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  29.59 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  28.53 
 
 		 359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.12 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.12 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  30.27 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  31.8 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.55 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  29.39 
 
 		 367 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  30.84 
 
 		 409 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  30.41 
 
 		 440 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.25 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  26.74 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  29.56 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  29.44 
 
 		 866 aa  107  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.4 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  31.25 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  30.77 
 
 		 424 aa  106  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  29.66 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  30.17 
 
 		 406 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  28.49 
 
 		 429 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.79 
 
 		 501 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  27.99 
 
 		 453 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  30.65 
 
 		 419 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  27.92 
 
 		 437 aa  104  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  30.42 
 
 		 600 aa  104  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.03 
 
 		 418 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.03 
 
 		 418 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  30.28 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  30.03 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.48 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  27 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  28.21 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  30.75 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  26.79 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  28.21 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  26.84 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  29.35 
 
 		 425 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  24.5 
 
 		 505 aa  99  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  29.69 
 
 		 338 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  27.2 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  29.33 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  31.19 
 
 		 431 aa  97.1  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  29.17 
 
 		 414 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>