More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2426 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  100 
 
 
501 aa  964    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41.29 
 
 
508 aa  327  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.11 
 
 
509 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  57.1 
 
 
531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.35 
 
 
531 aa  319  7e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  51.63 
 
 
546 aa  317  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41.36 
 
 
545 aa  317  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  38.37 
 
 
534 aa  309  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  44.35 
 
 
488 aa  305  8.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  39.13 
 
 
528 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  37.97 
 
 
531 aa  298  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  49.85 
 
 
542 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  39.2 
 
 
511 aa  293  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  36.94 
 
 
554 aa  292  8e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.05 
 
 
525 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.88 
 
 
505 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  40.95 
 
 
523 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.05 
 
 
508 aa  280  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  40.72 
 
 
515 aa  279  9e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.85 
 
 
505 aa  279  9e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  39.76 
 
 
538 aa  276  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  48.23 
 
 
608 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  48.41 
 
 
512 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.41 
 
 
512 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.41 
 
 
512 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.59 
 
 
520 aa  270  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.81 
 
 
521 aa  270  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.1 
 
 
512 aa  266  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  35.53 
 
 
570 aa  262  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  42.59 
 
 
524 aa  260  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.46 
 
 
552 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.33 
 
 
532 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41 
 
 
501 aa  236  9e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.38 
 
 
465 aa  213  9e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  39.87 
 
 
505 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  33.62 
 
 
489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.79 
 
 
512 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  31.72 
 
 
403 aa  131  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.03 
 
 
412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  32.58 
 
 
401 aa  130  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  32.48 
 
 
405 aa  126  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  32.48 
 
 
405 aa  126  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.41 
 
 
415 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  31.19 
 
 
402 aa  123  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  31.19 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  30.28 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.35 
 
 
417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.86 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  32.52 
 
 
372 aa  121  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  33.23 
 
 
370 aa  121  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.53 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  32.25 
 
 
361 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  31.56 
 
 
402 aa  117  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  32.78 
 
 
369 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.94 
 
 
408 aa  116  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  30.34 
 
 
426 aa  116  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  30.5 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  27.75 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  30.63 
 
 
402 aa  114  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.3 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  28.75 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  29.39 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.03 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  33.09 
 
 
379 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  35.48 
 
 
229 aa  109  9.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.45 
 
 
415 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  30.82 
 
 
420 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  28.44 
 
 
369 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  31.65 
 
 
414 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  28.31 
 
 
414 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  29.87 
 
 
407 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.73 
 
 
400 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  28.99 
 
 
401 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  28.9 
 
 
369 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  29.59 
 
 
417 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  33.73 
 
 
359 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  30.46 
 
 
431 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  28.9 
 
 
451 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.87 
 
 
453 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  31.31 
 
 
338 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  31.01 
 
 
409 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.41 
 
 
416 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.56 
 
 
418 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.56 
 
 
418 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  32.23 
 
 
418 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  30.92 
 
 
425 aa  100  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  29.04 
 
 
427 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  34.08 
 
 
270 aa  99.8  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  30.3 
 
 
431 aa  99  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  29.3 
 
 
424 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  30.03 
 
 
414 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  31.48 
 
 
406 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  28.9 
 
 
419 aa  97.8  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  26.73 
 
 
410 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.48 
 
 
402 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.95 
 
 
207 aa  97.4  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.87 
 
 
199 aa  97.1  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.09 
 
 
209 aa  97.1  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  28.53 
 
 
419 aa  97.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.18 
 
 
409 aa  97.1  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>