More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6027 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  92.68 
 
 		 369 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 		 369 aa  750    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  95.39 
 
 		 369 aa  693    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  41.18 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  37.82 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  32.34 
 
 		 412 aa  202  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  35.24 
 
 		 369 aa  199  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  33.06 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  34.15 
 
 		 410 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.81 
 
 		 453 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  35.26 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  30.22 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.68 
 
 		 406 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  35.33 
 
 		 370 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.51 
 
 		 415 aa  186  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  36.64 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  31.87 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  35.96 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.69 
 
 		 416 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  32.87 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  36.89 
 
 		 414 aa  180  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.06 
 
 		 417 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  33.72 
 
 		 407 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.88 
 
 		 434 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.78 
 
 		 408 aa  179  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.24 
 
 		 400 aa  179  8e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  35.99 
 
 		 361 aa  179  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  35.37 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  32.78 
 
 		 401 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  34.08 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  34.08 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.14 
 
 		 400 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  32.39 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  33.43 
 
 		 405 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  33.43 
 
 		 405 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  30.14 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  32.94 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  31.76 
 
 		 410 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.44 
 
 		 501 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  35.84 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.21 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.49 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.25 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  34.48 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  32.92 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  34.69 
 
 		 427 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  32.6 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  31.07 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  28.06 
 
 		 457 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  32.29 
 
 		 425 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  34.49 
 
 		 367 aa  149  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  32.93 
 
 		 440 aa  149  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.86 
 
 		 412 aa  149  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  33.75 
 
 		 430 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  32.53 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  29.16 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  32.6 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  28.88 
 
 		 461 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  33.86 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  33.86 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  30.31 
 
 		 427 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  29.97 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  29.89 
 
 		 409 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  30.28 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.49 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.52 
 
 		 430 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  32.81 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.02 
 
 		 416 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.91 
 
 		 418 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.91 
 
 		 418 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  32.48 
 
 		 409 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  33.85 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  29.72 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  33.23 
 
 		 424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.12 
 
 		 412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.12 
 
 		 412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  31.33 
 
 		 419 aa  133  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  32.59 
 
 		 418 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  29.44 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  28.77 
 
 		 891 aa  133  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  31.69 
 
 		 437 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  32.85 
 
 		 414 aa  132  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.21 
 
 		 415 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.89 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.89 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  29.91 
 
 		 417 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  29.25 
 
 		 453 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  28.98 
 
 		 445 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  31.15 
 
 		 406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.49 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.89 
 
 		 465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  29.03 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  29.36 
 
 		 405 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  29.66 
 
 		 425 aa  125  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  31.73 
 
 		 423 aa  125  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  28.61 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  29.65 
 
 		 449 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.31 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  29.27 
 
 		 554 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>