More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5388 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
403 aa  820    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  73.95 
 
 
401 aa  614  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  79.14 
 
 
402 aa  615  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  71.22 
 
 
403 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  70.97 
 
 
402 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  68.07 
 
 
401 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  66.67 
 
 
405 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  66.67 
 
 
405 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  65 
 
 
400 aa  548  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  65.6 
 
 
406 aa  531  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  63.03 
 
 
402 aa  528  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  64.02 
 
 
410 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  65.95 
 
 
417 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  59.7 
 
 
408 aa  468  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.94 
 
 
406 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  61.03 
 
 
379 aa  433  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  52.87 
 
 
414 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  57.84 
 
 
407 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  54.55 
 
 
414 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  51.07 
 
 
446 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.27 
 
 
416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  50.41 
 
 
412 aa  355  6.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  41.97 
 
 
412 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  47.12 
 
 
426 aa  310  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  46.26 
 
 
434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  40.24 
 
 
370 aa  209  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  39.52 
 
 
372 aa  206  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  33.84 
 
 
451 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  33.49 
 
 
409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  37.99 
 
 
414 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  37.85 
 
 
369 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  33.25 
 
 
410 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  35.11 
 
 
369 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  34.93 
 
 
369 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  33.92 
 
 
420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  34.37 
 
 
369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.31 
 
 
416 aa  184  3e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.7 
 
 
411 aa  182  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.44 
 
 
417 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  35.4 
 
 
406 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.92 
 
 
412 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.92 
 
 
412 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.62 
 
 
453 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  35.44 
 
 
408 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  33.42 
 
 
457 aa  176  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  35.1 
 
 
417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  31.89 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  31.89 
 
 
461 aa  173  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  35.24 
 
 
408 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  32.38 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  36.08 
 
 
361 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.4 
 
 
415 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.98 
 
 
409 aa  156  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  34.3 
 
 
407 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.94 
 
 
405 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  34.57 
 
 
367 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  31.7 
 
 
363 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  36.39 
 
 
376 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.53 
 
 
408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.94 
 
 
408 aa  146  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.23 
 
 
408 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  32.06 
 
 
407 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  32.31 
 
 
359 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.72 
 
 
501 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  31.04 
 
 
408 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.56 
 
 
508 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.61 
 
 
415 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  34.36 
 
 
440 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  33.86 
 
 
430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.99 
 
 
400 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  31.72 
 
 
501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  33.02 
 
 
437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  31.65 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  30.19 
 
 
431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  32.84 
 
 
429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  34.63 
 
 
427 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
423 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  30.86 
 
 
425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  33.12 
 
 
542 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.79 
 
 
509 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  29.98 
 
 
414 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  32.85 
 
 
431 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  28.4 
 
 
437 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  30.79 
 
 
425 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  31.61 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  30.84 
 
 
445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  29.15 
 
 
428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  32.38 
 
 
424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  29.15 
 
 
428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.61 
 
 
402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  31.95 
 
 
1016 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  30.84 
 
 
449 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.48 
 
 
456 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  31.36 
 
 
349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  30.18 
 
 
406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  32.7 
 
 
531 aa  120  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.23 
 
 
525 aa  120  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  31.49 
 
 
405 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  32.39 
 
 
528 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.23 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>