More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0432 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  100 
 
 
409 aa  829    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  35.32 
 
 
420 aa  208  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  34.54 
 
 
402 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  33.66 
 
 
401 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  35.81 
 
 
461 aa  206  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  35.54 
 
 
461 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  35.91 
 
 
403 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  35.1 
 
 
405 aa  202  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  35.1 
 
 
405 aa  202  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  32.93 
 
 
401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  33.49 
 
 
403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  34.6 
 
 
402 aa  199  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  32.86 
 
 
410 aa  199  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.88 
 
 
400 aa  192  8e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  38.9 
 
 
417 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.55 
 
 
453 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  35.28 
 
 
409 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  34.24 
 
 
406 aa  187  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  33.79 
 
 
402 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  33.33 
 
 
451 aa  186  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.95 
 
 
417 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  31.75 
 
 
457 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  37.71 
 
 
407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  32.93 
 
 
410 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  31.25 
 
 
363 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  37.32 
 
 
406 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30 
 
 
414 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  31.68 
 
 
408 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  31.53 
 
 
408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  36.87 
 
 
405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  32.05 
 
 
407 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.61 
 
 
417 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.34 
 
 
409 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.88 
 
 
412 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  32.24 
 
 
446 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.94 
 
 
411 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  30.44 
 
 
412 aa  169  7e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.26 
 
 
408 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.03 
 
 
408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  32.26 
 
 
367 aa  166  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  32.35 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  33.71 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  32.89 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  28.72 
 
 
600 aa  164  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  30.79 
 
 
408 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
426 aa  162  9e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.88 
 
 
416 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.95 
 
 
408 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.12 
 
 
416 aa  158  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  32.12 
 
 
379 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.11 
 
 
412 aa  155  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.11 
 
 
412 aa  155  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.4 
 
 
408 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  35.17 
 
 
349 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  32.39 
 
 
414 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  33.55 
 
 
429 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  29 
 
 
406 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  30.79 
 
 
407 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  33.53 
 
 
376 aa  149  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.71 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.27 
 
 
418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.27 
 
 
418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  32.49 
 
 
437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.71 
 
 
434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  31.23 
 
 
405 aa  146  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  34.72 
 
 
406 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  34.27 
 
 
418 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  30.71 
 
 
414 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  32.17 
 
 
409 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  29.13 
 
 
369 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  30.25 
 
 
425 aa  142  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  29.79 
 
 
428 aa  143  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  29.79 
 
 
428 aa  143  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  30.17 
 
 
369 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  28.81 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  30.46 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  29.89 
 
 
369 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  31.92 
 
 
419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.9 
 
 
400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  30.03 
 
 
419 aa  139  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  32.87 
 
 
424 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  29.11 
 
 
427 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  29.2 
 
 
431 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  31.31 
 
 
414 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.16 
 
 
425 aa  136  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  33.76 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  33.76 
 
 
402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.64 
 
 
415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  32.27 
 
 
423 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  28.61 
 
 
359 aa  133  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.5 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  31.38 
 
 
866 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  28.31 
 
 
420 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  29.97 
 
 
427 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  29.91 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  28.27 
 
 
380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  25.92 
 
 
445 aa  126  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  30.81 
 
 
431 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  29.32 
 
 
414 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  29.02 
 
 
437 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>