258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0035 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  85.75 
 
 
417 aa  639    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  100 
 
 
406 aa  823    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  72.87 
 
 
409 aa  561  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  67.68 
 
 
405 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  58.02 
 
 
409 aa  471  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  54.61 
 
 
407 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  34.39 
 
 
401 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  35.22 
 
 
409 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  34.63 
 
 
403 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.46 
 
 
415 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  36.44 
 
 
406 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  34.29 
 
 
401 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  35.2 
 
 
402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  35.2 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.25 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.63 
 
 
414 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  35.61 
 
 
402 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  34.12 
 
 
405 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  34.12 
 
 
405 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.78 
 
 
453 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 
400 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.72 
 
 
415 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  34.33 
 
 
402 aa  167  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  35.22 
 
 
410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.81 
 
 
416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  34.81 
 
 
461 aa  163  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  34.81 
 
 
461 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.05 
 
 
417 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.52 
 
 
408 aa  160  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  33.98 
 
 
420 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  33.33 
 
 
361 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.04 
 
 
411 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  33.04 
 
 
414 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  33.06 
 
 
426 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  34.02 
 
 
417 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  31.78 
 
 
376 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.44 
 
 
434 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.52 
 
 
412 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  32.18 
 
 
408 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  31.52 
 
 
412 aa  150  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.27 
 
 
410 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  32.94 
 
 
370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  32.16 
 
 
407 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.92 
 
 
416 aa  142  9e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  31.47 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  30.98 
 
 
414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  32.25 
 
 
446 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.5 
 
 
406 aa  136  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  31.52 
 
 
451 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  32.44 
 
 
372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  28.95 
 
 
407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  30.31 
 
 
408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.55 
 
 
408 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  33.23 
 
 
408 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  30.98 
 
 
369 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.62 
 
 
408 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  32.21 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  31 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.21 
 
 
412 aa  131  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.21 
 
 
412 aa  131  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  29.91 
 
 
369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  31.5 
 
 
367 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  31.94 
 
 
424 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  31.79 
 
 
359 aa  126  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  30.13 
 
 
405 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  29.44 
 
 
600 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  33.13 
 
 
419 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  29.81 
 
 
369 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  28.53 
 
 
363 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  31.38 
 
 
430 aa  123  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  33.86 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  31.63 
 
 
427 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  31.96 
 
 
349 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  27.81 
 
 
505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.03 
 
 
501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.16 
 
 
501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.3 
 
 
512 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  30.91 
 
 
409 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  29.38 
 
 
420 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  33.82 
 
 
419 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  28.14 
 
 
489 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.76 
 
 
418 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.76 
 
 
418 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  30.34 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  27.41 
 
 
453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  28.36 
 
 
338 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  33.44 
 
 
418 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  28.66 
 
 
440 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  29.74 
 
 
429 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.9 
 
 
456 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  30.55 
 
 
406 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  28.88 
 
 
431 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  28.3 
 
 
437 aa  107  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.52 
 
 
414 aa  107  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  26.48 
 
 
414 aa  107  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.55 
 
 
402 aa  106  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  27.38 
 
 
425 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  29.38 
 
 
380 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.06 
 
 
415 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>