179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0007 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  90.44 
 
 
408 aa  782    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
408 aa  845    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  98.04 
 
 
408 aa  829    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  98.04 
 
 
408 aa  830    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  69.61 
 
 
408 aa  636    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  68.63 
 
 
408 aa  633  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.61 
 
 
417 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  50 
 
 
410 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.42 
 
 
411 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  50.56 
 
 
457 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.88 
 
 
412 aa  355  8.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.88 
 
 
412 aa  355  8.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  48.42 
 
 
416 aa  355  8.999999999999999e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  43.9 
 
 
420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  40.76 
 
 
461 aa  315  6e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  40.52 
 
 
461 aa  315  9e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  44.19 
 
 
451 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.94 
 
 
453 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  30.22 
 
 
412 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  31.26 
 
 
409 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  30.75 
 
 
426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  34.56 
 
 
361 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.93 
 
 
417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  29.51 
 
 
410 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  30.45 
 
 
414 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  32.63 
 
 
359 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  31.66 
 
 
402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  29.33 
 
 
363 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.4 
 
 
412 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.97 
 
 
416 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  31.53 
 
 
403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  28.27 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.9 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.86 
 
 
406 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  28.95 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  30.34 
 
 
406 aa  146  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  31.69 
 
 
405 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  31.69 
 
 
405 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.91 
 
 
434 aa  143  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.5 
 
 
401 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  26.84 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.92 
 
 
415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  29.61 
 
 
407 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  30.89 
 
 
402 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  31.61 
 
 
414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  30.31 
 
 
370 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.64 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.46 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  29.79 
 
 
369 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  29.53 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  32.42 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  28.86 
 
 
369 aa  130  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  28.87 
 
 
369 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  29.23 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  29.23 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.2 
 
 
400 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  30.85 
 
 
407 aa  126  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  27.7 
 
 
367 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.78 
 
 
405 aa  123  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  31.05 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  31.64 
 
 
407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.5 
 
 
409 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  29 
 
 
428 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  29 
 
 
428 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  30 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  27.03 
 
 
600 aa  113  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08058  sulfite oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02190)  26.25 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  28.82 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  31.25 
 
 
409 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  29.88 
 
 
429 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  27.08 
 
 
1016 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.1 
 
 
418 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.1 
 
 
418 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  28.1 
 
 
418 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.57 
 
 
376 aa  106  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  26.88 
 
 
414 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  27.79 
 
 
419 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.96 
 
 
501 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  28.3 
 
 
453 aa  103  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  28.17 
 
 
406 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  30.24 
 
 
449 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.17 
 
 
415 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  29.64 
 
 
451 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  27.39 
 
 
866 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  28.88 
 
 
414 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  28.88 
 
 
431 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  27.33 
 
 
427 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  28.96 
 
 
431 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  29.94 
 
 
445 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  29.31 
 
 
448 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  28.05 
 
 
419 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  27.64 
 
 
430 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  26.9 
 
 
420 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  27.84 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  28.75 
 
 
405 aa  96.3  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  27.69 
 
 
891 aa  96.3  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  26.54 
 
 
437 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  25.94 
 
 
440 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01006  Nitrate reductase [NADPH] (NR)(EC 1.7.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22945]  27.44 
 
 
873 aa  92.8  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  30.12 
 
 
457 aa  92.8  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>