More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4023 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 		 521 aa  1021    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  46.34 
 
 		 546 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.35 
 
 		 545 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  43.97 
 
 		 534 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.82 
 
 		 531 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.41 
 
 		 525 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  42.77 
 
 		 531 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  43.15 
 
 		 528 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  47.65 
 
 		 531 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.27 
 
 		 505 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.59 
 
 		 515 aa  359  6e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.99 
 
 		 505 aa  354  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  46.14 
 
 		 538 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.91 
 
 		 511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  45.8 
 
 		 524 aa  351  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  46.27 
 
 		 488 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.51 
 
 		 520 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  44.75 
 
 		 512 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.75 
 
 		 512 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.75 
 
 		 512 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  43.06 
 
 		 554 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  46.08 
 
 		 570 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  44.03 
 
 		 523 aa  344  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43 
 
 		 512 aa  342  7e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  40.69 
 
 		 542 aa  339  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.04 
 
 		 509 aa  334  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.77 
 
 		 508 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  51.54 
 
 		 608 aa  321  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  51.6 
 
 		 532 aa  300  6e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.85 
 
 		 508 aa  281  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  44.24 
 
 		 501 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.58 
 
 		 552 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  33.2 
 
 		 489 aa  195  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.41 
 
 		 501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  35.15 
 
 		 505 aa  169  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.58 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  31.22 
 
 		 528 aa  161  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.99 
 
 		 512 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.97 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  32.67 
 
 		 402 aa  123  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  30.57 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  30.57 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.15 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  29.97 
 
 		 376 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  29.03 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  30.77 
 
 		 403 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  29.38 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  32.23 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  31.96 
 
 		 372 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  28.87 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  33.04 
 
 		 401 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  29.67 
 
 		 410 aa  99.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  28.9 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  28.9 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  30.7 
 
 		 359 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  30.19 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.33 
 
 		 200 aa  99  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  28.96 
 
 		 431 aa  96.7  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.36 
 
 		 412 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.84 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  28.2 
 
 		 409 aa  95.1  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  26.8 
 
 		 405 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  32.05 
 
 		 367 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.45 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  25.51 
 
 		 369 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  30.19 
 
 		 446 aa  92.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  27.86 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  27.86 
 
 		 461 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  28.34 
 
 		 407 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  28.78 
 
 		 417 aa  91.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  32.88 
 
 		 370 aa  91.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  27.45 
 
 		 414 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  28.42 
 
 		 229 aa  91.3  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.5 
 
 		 415 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.55 
 
 		 400 aa  90.5  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  24.71 
 
 		 369 aa  90.1  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  27.03 
 
 		 420 aa  90.1  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  29.73 
 
 		 406 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  29.73 
 
 		 402 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  28.86 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  31.48 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  26.82 
 
 		 412 aa  89.4  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  28.89 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.05 
 
 		 199 aa  88.2  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  27.98 
 
 		 426 aa  88.2  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.76 
 
 		 237 aa  87.4  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.74 
 
 		 209 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  27.3 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  25.47 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  28.52 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  26.65 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  28.16 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.54 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.54 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  34.9 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.49 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.74 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  30.39 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  29.54 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.64 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>