38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1924 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  100 
 
 
523 aa  1040    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1925  hypothetical protein  47.11 
 
 
401 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11551  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1926  hypothetical protein  47.45 
 
 
266 aa  219  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  29.58 
 
 
642 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  45.29 
 
 
1744 aa  136  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  47.13 
 
 
1051 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  45.52 
 
 
1785 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  41.88 
 
 
1282 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  44.23 
 
 
2337 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  44.1 
 
 
1752 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  40.38 
 
 
1838 aa  123  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  41.28 
 
 
1728 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  42.14 
 
 
631 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  40 
 
 
1009 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  47.59 
 
 
1781 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0745  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  29.63 
 
 
545 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  hitchhiker  0.00012998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  40.96 
 
 
1627 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  41.78 
 
 
1589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  35.75 
 
 
2135 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  35.81 
 
 
1005 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  40.91 
 
 
430 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  39.16 
 
 
824 aa  99.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0186  hypothetical protein  31.39 
 
 
395 aa  94.7  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  36.4 
 
 
1278 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.88 
 
 
1066 aa  87.4  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6550  hypothetical protein  31.48 
 
 
277 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.236585 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  31.96 
 
 
1389 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1000  Parallel beta-helix repeat protein  31.8 
 
 
710 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349147  hitchhiker  0.00938388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6551  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.56 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1572  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.56 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  38.2 
 
 
119 aa  65.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0650  hypothetical protein  28.83 
 
 
300 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0894  parallel beta-helix repeat protein  25.56 
 
 
755 aa  62.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4479  hypothetical protein  27.88 
 
 
355 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2522  hypothetical protein  27.54 
 
 
346 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165755  normal  0.604183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4483  hypothetical protein  36.78 
 
 
439 aa  44.3  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  29.78 
 
 
621 aa  43.9  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  29.78 
 
 
621 aa  43.9  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>