40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0649 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  100 
 
 
642 aa  1281    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0650  hypothetical protein  76.76 
 
 
300 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  39.91 
 
 
1282 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  29.34 
 
 
523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  48.92 
 
 
2337 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  46.72 
 
 
1728 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  45.32 
 
 
1752 aa  120  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  44.76 
 
 
1838 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  40.54 
 
 
1785 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  41.89 
 
 
1744 aa  115  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  41.07 
 
 
1781 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  34.16 
 
 
631 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  41.88 
 
 
1051 aa  111  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  44.53 
 
 
1589 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  42.07 
 
 
1627 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  44.31 
 
 
824 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  36.69 
 
 
2135 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  39.04 
 
 
1009 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  36.96 
 
 
1005 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  38.55 
 
 
1389 aa  97.8  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  42.11 
 
 
430 aa  94.7  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.3 
 
 
1066 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  40 
 
 
119 aa  89  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0745  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  29.06 
 
 
545 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  hitchhiker  0.00012998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1925  hypothetical protein  28.04 
 
 
401 aa  79  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11551  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  36.78 
 
 
2313 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  41.29 
 
 
830 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0186  hypothetical protein  33.03 
 
 
395 aa  62.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  30.88 
 
 
1278 aa  58.9  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1926  hypothetical protein  29.29 
 
 
266 aa  57  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  27.24 
 
 
671 aa  50.8  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  50 
 
 
1281 aa  50.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  39.81 
 
 
489 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  36.94 
 
 
846 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1000  Parallel beta-helix repeat protein  26.72 
 
 
710 aa  48.5  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349147  hitchhiker  0.00938388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  40.86 
 
 
203 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  35.22 
 
 
2353 aa  48.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  42.67 
 
 
625 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2129  hypothetical protein  34.75 
 
 
487 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  35.34 
 
 
489 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>