55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5077 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  100 
 
 
1009 aa  1985    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  51.83 
 
 
1282 aa  436  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  48.98 
 
 
1627 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  45.91 
 
 
1785 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  45.93 
 
 
1838 aa  344  5e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  43.62 
 
 
824 aa  315  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  46.8 
 
 
1589 aa  298  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  43.54 
 
 
1752 aa  287  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  42.53 
 
 
1781 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  41.99 
 
 
1744 aa  275  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  43.59 
 
 
631 aa  178  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  38.65 
 
 
2135 aa  175  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  58.17 
 
 
2337 aa  171  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  49.69 
 
 
1051 aa  166  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  33.72 
 
 
1389 aa  165  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  43.25 
 
 
1728 aa  162  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  32.66 
 
 
1005 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  43.31 
 
 
523 aa  127  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  36.84 
 
 
430 aa  110  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  44.44 
 
 
642 aa  107  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.13 
 
 
1066 aa  100  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  47.92 
 
 
119 aa  94.4  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  32.67 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  33.49 
 
 
6272 aa  71.6  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  27.69 
 
 
377 aa  67  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  30.95 
 
 
299 aa  64.7  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  30.1 
 
 
294 aa  63.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  41.38 
 
 
651 aa  62  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  36.81 
 
 
1627 aa  62  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  29.26 
 
 
291 aa  61.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  30.73 
 
 
1490 aa  61.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5035  NHL repeat containing protein  29.72 
 
 
455 aa  55.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114728  decreased coverage  0.00343119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  40.5 
 
 
595 aa  55.1  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  27.88 
 
 
285 aa  55.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  25.46 
 
 
296 aa  53.5  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  34.48 
 
 
1762 aa  53.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.58 
 
 
1590 aa  51.6  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  31.46 
 
 
486 aa  51.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  29.89 
 
 
331 aa  50.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0098  protease-like  30.39 
 
 
1223 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.34808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  37.5 
 
 
1686 aa  49.3  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  37.86 
 
 
1026 aa  48.5  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  33.11 
 
 
326 aa  48.5  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5817  hypothetical protein  31.16 
 
 
272 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  35.14 
 
 
4761 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  26.28 
 
 
316 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  33.64 
 
 
1126 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  29.83 
 
 
392 aa  47.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  37.86 
 
 
368 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  31.69 
 
 
1245 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  30.39 
 
 
656 aa  47  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  32.72 
 
 
352 aa  47  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  25.78 
 
 
316 aa  45.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0105  protease-like  35.35 
 
 
1478 aa  45.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.34808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  26.22 
 
 
290 aa  45.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>