37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0904 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  100 
 
 
552 aa  1112    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  52.4 
 
 
565 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  45.96 
 
 
528 aa  415  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  37.1 
 
 
553 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  37.37 
 
 
569 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  32.78 
 
 
584 aa  236  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  38.39 
 
 
458 aa  234  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  33.63 
 
 
556 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  32.49 
 
 
1785 aa  162  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  29.4 
 
 
1005 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  31.46 
 
 
1589 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  29.21 
 
 
509 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  31.35 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  31.39 
 
 
1728 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  28.31 
 
 
1051 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  31.01 
 
 
506 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  29.18 
 
 
2337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  28.54 
 
 
1838 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  30.84 
 
 
514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  29.11 
 
 
1781 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  29.28 
 
 
2135 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  30.59 
 
 
1752 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  28.07 
 
 
1627 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  28.3 
 
 
542 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  28.51 
 
 
1744 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  29.33 
 
 
1282 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  32.76 
 
 
1389 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  30.07 
 
 
614 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  30.26 
 
 
628 aa  80.9  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  26.23 
 
 
503 aa  75.5  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  26.19 
 
 
448 aa  73.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  24.81 
 
 
546 aa  63.9  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  24.75 
 
 
515 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  29.14 
 
 
559 aa  62  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  24.56 
 
 
547 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  24.82 
 
 
670 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  26.61 
 
 
717 aa  44.3  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>