39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5668 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  76.54 
 
 		 569 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  914    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  48.93 
 
 		 584 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  39.29 
 
 		 565 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  35.51 
 
 		 528 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  38.39 
 
 		 552 aa  234  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  34.51 
 
 		 553 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  33.64 
 
 		 556 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  30.28 
 
 		 1005 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  31.58 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  29.29 
 
 		 542 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1785 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  31.93 
 
 		 614 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  28.3 
 
 		 522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  27.4 
 
 		 514 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1838 aa  127  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  29.85 
 
 		 1051 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  29.13 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  35.43 
 
 		 1589 aa  118  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1627 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1781 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  28.17 
 
 		 1728 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  28.54 
 
 		 2337 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  26.67 
 
 		 2135 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1282 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  30.98 
 
 		 1752 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1744 aa  96.7  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  26.67 
 
 		 448 aa  90.9  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  24.18 
 
 		 503 aa  83.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  27.95 
 
 		 1389 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  23.53 
 
 		 541 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  24.78 
 
 		 546 aa  64.3  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  24.01 
 
 		 559 aa  63.2  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  22.08 
 
 		 515 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  25.2 
 
 		 670 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  26.92 
 
 		 628 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  23.08 
 
 		 547 aa  55.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  25.2 
 
 		 717 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  26.21 
 
 		 753 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>