64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8496 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  40.7 
 
 		 1627 aa  698    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  100 
 
 		 1282 aa  2574    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  41.56 
 
 		 1785 aa  758    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  39.43 
 
 		 1589 aa  664    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  40.6 
 
 		 1744 aa  684    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  39.43 
 
 		 1752 aa  619  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  39.87 
 
 		 1781 aa  616  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  40.73 
 
 		 1838 aa  599  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  42.27 
 
 		 1728 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  41.97 
 
 		 1051 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  42.52 
 
 		 2337 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  36.78 
 
 		 2135 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  34.83 
 
 		 1389 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  51.83 
 
 		 1009 aa  366  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  43.47 
 
 		 824 aa  315  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  31.31 
 
 		 1005 aa  188  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  51.59 
 
 		 631 aa  155  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  30.04 
 
 		 556 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  44.16 
 
 		 642 aa  129  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  27.27 
 
 		 509 aa  129  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  39.56 
 
 		 523 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  30.39 
 
 		 542 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  28.88 
 
 		 552 aa  113  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  30.55 
 
 		 569 aa  111  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  26.8 
 
 		 522 aa  111  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  29.77 
 
 		 553 aa  109  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  27.61 
 
 		 565 aa  108  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  40 
 
 		 430 aa  107  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.92 
 
 		 1066 aa  106  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  25.88 
 
 		 528 aa  105  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  31.08 
 
 		 458 aa  101  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  28.42 
 
 		 584 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  42.2 
 
 		 119 aa  86.3  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  29.21 
 
 		 614 aa  84.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  27 
 
 		 506 aa  84.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  26.09 
 
 		 514 aa  84.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  27.09 
 
 		 503 aa  74.3  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  35.53 
 
 		 1762 aa  64.3  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  39.64 
 
 		 651 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  26.18 
 
 		 448 aa  60.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  41.03 
 
 		 1627 aa  60.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  23.96 
 
 		 515 aa  59.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  43.4 
 
 		 368 aa  58.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  36.44 
 
 		 1590 aa  58.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  25.32 
 
 		 559 aa  56.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  39.05 
 
 		 685 aa  56.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  40.74 
 
 		 656 aa  55.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  37.5 
 
 		 628 aa  55.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  40.74 
 
 		 595 aa  55.5  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  44 
 
 		 663 aa  52.8  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  24.15 
 
 		 547 aa  52.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 426 aa  51.6  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  37.5 
 
 		 1686 aa  51.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  33.87 
 
 		 4761 aa  51.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  36.79 
 
 		 486 aa  51.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  28.12 
 
 		 765 aa  50.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  23.45 
 
 		 546 aa  50.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  33.66 
 
 		 2117 aa  50.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  23.23 
 
 		 765 aa  47.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  35.24 
 
 		 693 aa  47  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  36.45 
 
 		 1026 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  30.94 
 
 		 1047 aa  46.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  37.97 
 
 		 635 aa  46.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0655  hypothetical protein  33.71 
 
 		 539 aa  46.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.507478  normal  0.0435014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>