46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1378 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 430 aa  844    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  55.21 
 
 		 1005 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  42.86 
 
 		 2337 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  42.17 
 
 		 1752 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  43.48 
 
 		 1781 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  38.86 
 
 		 1728 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  45.26 
 
 		 631 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  39.41 
 
 		 1282 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  44.87 
 
 		 1589 aa  113  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  42.47 
 
 		 1838 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  42.03 
 
 		 1051 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  38.05 
 
 		 642 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  43.59 
 
 		 1744 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  40.94 
 
 		 1627 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1009 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  40.74 
 
 		 1785 aa  104  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  41.91 
 
 		 523 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  35.03 
 
 		 2135 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  35.81 
 
 		 824 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  37.06 
 
 		 1389 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  43.16 
 
 		 119 aa  82.8  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  54.39 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  46.25 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  50.67 
 
 		 1047 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  44.16 
 
 		 499 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  40.79 
 
 		 892 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.63 
 
 		 1066 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  44.16 
 
 		 482 aa  53.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3967  fibronectin, type III domain-containing protein  43.21 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.476574  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0952  fibronectin, type III domain-containing protein  41.57 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  40.85 
 
 		 675 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  36.79 
 
 		 1067 aa  50.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3464  hypothetical protein  30.34 
 
 		 524 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242954  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  41.89 
 
 		 1217 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  34.21 
 
 		 864 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  52.73 
 
 		 840 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3181  Fibronectin type III domain protein  39.33 
 
 		 524 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  39.19 
 
 		 3802 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  54.1 
 
 		 555 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2851  hypothetical protein  37.93 
 
 		 765 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.215576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4840  hypothetical protein  51.67 
 
 		 908 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191443  hitchhiker  0.00180703 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03300  microtubule binding protein, putative  46.03 
 
 		 694 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  32.8 
 
 		 433 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45068  predicted protein  41.51 
 
 		 479 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0381  Fibronectin type III domain protein  41.41 
 
 		 277 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3739  hypothetical protein  48.78 
 
 		 128 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389983  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>