21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3464 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3464  hypothetical protein  100 
 
 		 524 aa  1057    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242954  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2851  hypothetical protein  52.85 
 
 		 765 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.215576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  44.66 
 
 		 1107 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  38.01 
 
 		 897 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  37.7 
 
 		 728 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3296  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 		 227 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0413937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2219  hypothetical protein  36.73 
 
 		 184 aa  87  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7062  lipolytic protein G-D-S-L family  35.42 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1351  hypothetical protein  25.21 
 
 		 239 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.946704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2158  lipolytic protein G-D-S-L family  33.85 
 
 		 226 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3739  hypothetical protein  37.4 
 
 		 128 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.38 
 
 		 1577 aa  71.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  46.43 
 
 		 763 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  45.12 
 
 		 760 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  51.79 
 
 		 743 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1378  hypothetical protein  50.88 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  35.53 
 
 		 550 aa  51.6  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  36.76 
 
 		 818 aa  51.6  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3914  hypothetical protein  31.88 
 
 		 522 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560084  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  27.66 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1651  GDSL family lipase  26.7 
 
 		 253 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>