16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2851 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2851  hypothetical protein  100 
 
 		 765 aa  1506    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.215576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1056  periplasmic protein/ biopolymer transport  59.16 
 
 		 513 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.838383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3464  hypothetical protein  52.9 
 
 		 524 aa  229  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242954  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  34.52 
 
 		 1107 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  30.4 
 
 		 897 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2219  hypothetical protein  36.75 
 
 		 184 aa  82.4  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  32.37 
 
 		 760 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  42.02 
 
 		 763 aa  72  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1378  hypothetical protein  39.84 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3739  hypothetical protein  34.21 
 
 		 128 aa  67.8  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  51.79 
 
 		 743 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.26 
 
 		 1577 aa  63.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  41.27 
 
 		 818 aa  55.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  31.47 
 
 		 840 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  35.53 
 
 		 550 aa  45.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  24.69 
 
 		 2313 aa  44.3  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>