22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1056 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1056  periplasmic protein/ biopolymer transport  100 
 
 
513 aa  998    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.838383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2851  hypothetical protein  61.02 
 
 
765 aa  488  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.215576  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  51.19 
 
 
840 aa  72.8  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  26.53 
 
 
268 aa  65.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  50.63 
 
 
555 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  47.3 
 
 
1217 aa  60.5  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4840  hypothetical protein  50 
 
 
908 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191443  hitchhiker  0.00180703 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  33.33 
 
 
551 aa  53.9  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  38.2 
 
 
489 aa  53.5  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  47.37 
 
 
248 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  33 
 
 
407 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.58 
 
 
2313 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  31.67 
 
 
521 aa  47.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  30.86 
 
 
1000 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  31.97 
 
 
1888 aa  46.2  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45068  predicted protein  32.5 
 
 
479 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  32.86 
 
 
433 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47575  predicted protein  28.57 
 
 
744 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759441  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.46 
 
 
257 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  42.11 
 
 
687 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  29.66 
 
 
671 aa  43.5  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06210  Pol II transcription elongation factor, putative  47.3 
 
 
1152 aa  43.9  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>