25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0815 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  100 
 
 
760 aa  1561    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  61.74 
 
 
763 aa  888    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  87.65 
 
 
743 aa  1315    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3875  hypothetical protein  50.33 
 
 
659 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0810  hypothetical protein  50.08 
 
 
658 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1200  hypothetical protein  50.78 
 
 
640 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000043038  normal  0.447188 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5604  hypothetical protein  39.89 
 
 
772 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152191  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4500  hypothetical protein  39.48 
 
 
748 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0820  hypothetical protein  43.91 
 
 
761 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  25.39 
 
 
1276 aa  73.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1378  hypothetical protein  37 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2851  hypothetical protein  48.28 
 
 
765 aa  64.3  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.215576  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3464  hypothetical protein  49.12 
 
 
524 aa  62  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242954  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  24.68 
 
 
1086 aa  61.2  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  44.64 
 
 
1107 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  44.44 
 
 
897 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  25.44 
 
 
873 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2219  hypothetical protein  42.59 
 
 
184 aa  48.5  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0574  hypothetical protein  40 
 
 
183 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0518194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  41.38 
 
 
1500 aa  47  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  21.79 
 
 
1141 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3739  hypothetical protein  43.64 
 
 
128 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389983  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  24.9 
 
 
530 aa  44.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.35 
 
 
1577 aa  44.3  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3180  hypothetical protein  34.58 
 
 
170 aa  44.3  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>