21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1378 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1378  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  870    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1049  hypothetical protein  68.1 
 
 		 279 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5069  hypothetical protein  30.67 
 
 		 778 aa  100  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.134968 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4608  hypothetical protein  30.67 
 
 		 778 aa  100  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.042259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5107  hypothetical protein  31.18 
 
 		 794 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.819284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  37 
 
 		 760 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  32.58 
 
 		 601 aa  63.5  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3464  hypothetical protein  50.88 
 
 		 524 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242954  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  47.54 
 
 		 818 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2851  hypothetical protein  51.72 
 
 		 765 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.215576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1984  hypothetical protein  28.89 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  43.28 
 
 		 743 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  44.83 
 
 		 763 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  40.32 
 
 		 1107 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  43.33 
 
 		 897 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3739  hypothetical protein  49.18 
 
 		 128 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2219  hypothetical protein  45.61 
 
 		 184 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  30.48 
 
 		 550 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.14 
 
 		 1577 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  43.1 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0820  hypothetical protein  30.77 
 
 		 761 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>