51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0820 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3875  hypothetical protein  58.08 
 
 		 659 aa  681    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0820  hypothetical protein  100 
 
 		 761 aa  1536    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0810  hypothetical protein  58.22 
 
 		 658 aa  686    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4500  hypothetical protein  95.78 
 
 		 748 aa  1173    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5604  hypothetical protein  83.07 
 
 		 772 aa  1218    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1200  hypothetical protein  53.98 
 
 		 640 aa  617  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000043038  normal  0.447188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  41.08 
 
 		 763 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  40.61 
 
 		 760 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  39.1 
 
 		 743 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  38.98 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  47.44 
 
 		 1281 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  46.58 
 
 		 268 aa  56.2  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  39.47 
 
 		 667 aa  55.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  24.46 
 
 		 1276 aa  55.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  51.32 
 
 		 555 aa  55.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  43.04 
 
 		 846 aa  54.7  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  49.25 
 
 		 840 aa  54.3  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  47.76 
 
 		 551 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  21.12 
 
 		 1141 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  45.74 
 
 		 830 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1086 aa  52.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  41.03 
 
 		 489 aa  53.5  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  43.21 
 
 		 1217 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  42.5 
 
 		 916 aa  52  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  54.55 
 
 		 444 aa  52  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  43.9 
 
 		 673 aa  50.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  48.53 
 
 		 671 aa  50.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.54 
 
 		 257 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5165  hypothetical protein  46.55 
 
 		 570 aa  48.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0452988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  55.56 
 
 		 430 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03300  microtubule binding protein, putative  44.58 
 
 		 694 aa  47.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1378  hypothetical protein  28.08 
 
 		 430 aa  47.4  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  40.85 
 
 		 488 aa  47.4  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  55.17 
 
 		 329 aa  47.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  35.92 
 
 		 2313 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2129  hypothetical protein  57.14 
 
 		 487 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  31.25 
 
 		 682 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  34.35 
 
 		 458 aa  46.6  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49209  predicted protein  40 
 
 		 526 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0370698  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  46.97 
 
 		 778 aa  45.8  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  36.3 
 
 		 914 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  29.92 
 
 		 521 aa  45.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  27.18 
 
 		 586 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.5 
 
 		 261 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  38 
 
 		 1279 aa  44.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  60.53 
 
 		 431 aa  44.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  36.27 
 
 		 500 aa  44.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  46.67 
 
 		 243 aa  44.3  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  49.25 
 
 		 771 aa  44.3  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  50 
 
 		 472 aa  44.3  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44203  predicted protein  37.62 
 
 		 658 aa  44.3  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>