13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3875 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3875  hypothetical protein  100 
 
 		 659 aa  1325    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0820  hypothetical protein  58.08 
 
 		 761 aa  672    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1200  hypothetical protein  71.4 
 
 		 640 aa  835    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000043038  normal  0.447188 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5604  hypothetical protein  55.52 
 
 		 772 aa  659    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4500  hypothetical protein  57.34 
 
 		 748 aa  675    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0810  hypothetical protein  92.61 
 
 		 658 aa  1135    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  50.33 
 
 		 743 aa  595  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  50.5 
 
 		 763 aa  594  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  47.72 
 
 		 760 aa  594  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  22.74 
 
 		 1141 aa  74.7  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1086 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  24.23 
 
 		 1276 aa  54.7  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  29.25 
 
 		 530 aa  48.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>