44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4500 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3875  hypothetical protein  57.21 
 
 		 659 aa  672    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0820  hypothetical protein  95.78 
 
 		 761 aa  1152    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0810  hypothetical protein  58.08 
 
 		 658 aa  680    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4500  hypothetical protein  100 
 
 		 748 aa  1513    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5604  hypothetical protein  85.01 
 
 		 772 aa  1233    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1200  hypothetical protein  54.07 
 
 		 640 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000043038  normal  0.447188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  40.62 
 
 		 763 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  39.76 
 
 		 760 aa  511  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  37.64 
 
 		 743 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  39.64 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  55.74 
 
 		 1281 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1086 aa  55.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  53.75 
 
 		 830 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  23.97 
 
 		 1276 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  22.06 
 
 		 1141 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  44.44 
 
 		 489 aa  52  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  50.7 
 
 		 771 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  38.71 
 
 		 846 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  40 
 
 		 914 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  48 
 
 		 667 aa  50.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  58.14 
 
 		 430 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.04 
 
 		 257 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 628 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  44.83 
 
 		 1409 aa  48.5  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  41.05 
 
 		 1279 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  65.12 
 
 		 1034 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  36.52 
 
 		 431 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  60.47 
 
 		 253 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  48.33 
 
 		 916 aa  46.6  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  35.63 
 
 		 488 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  61.7 
 
 		 778 aa  46.6  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  53.33 
 
 		 457 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  59.57 
 
 		 329 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  26.21 
 
 		 586 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  44.26 
 
 		 551 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  38.67 
 
 		 682 aa  45.8  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  50 
 
 		 268 aa  45.4  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  49.3 
 
 		 671 aa  45.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2129  hypothetical protein  49.15 
 
 		 487 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  39.18 
 
 		 772 aa  44.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  52.54 
 
 		 455 aa  44.3  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  42.42 
 
 		 555 aa  44.3  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1378  hypothetical protein  29.25 
 
 		 430 aa  44.3  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  27.17 
 
 		 534 aa  43.9  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>