13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1434 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  100 
 
 		 772 aa  1557    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5078  hypothetical protein  63.84 
 
 		 809 aa  951    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal  0.0204601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1140  hypothetical protein  45.74 
 
 		 294 aa  206  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3053  hypothetical protein  46.26 
 
 		 643 aa  191  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4046  hypothetical protein  40.99 
 
 		 624 aa  180  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00161846  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7435  hypothetical protein  40.99 
 
 		 624 aa  180  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  31.4 
 
 		 947 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  30.71 
 
 		 909 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0409  hypothetical protein  28 
 
 		 519 aa  68.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1679  hypothetical protein  66.67 
 
 		 746 aa  60.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.548222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  44.07 
 
 		 2313 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  24.72 
 
 		 2449 aa  48.5  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  34.78 
 
 		 344 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>