266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2289 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  100 
 
 		 457 aa  947    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0884  Peptidase M23  46.04 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00022367  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  46.77 
 
 		 348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3569  peptidase M23B  45.05 
 
 		 328 aa  96.7  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5110  M24/M37 family peptidase  45.95 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4841  M24/M37 family peptidase  45.95 
 
 		 333 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.024057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4683  M24/M37 family peptidase  45.95 
 
 		 333 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4699  M24/M37 family peptidase  45.95 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0776348  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5206  M23/37 family peptidase  45.95 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0123  peptidase, M23/M37 family  45.95 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0859179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5077  peptidase, M23/M37 family  45.95 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5115  peptidase, M23/M37 family  45.95 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000714252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5117  peptidase, M23/M37 family  45.05 
 
 		 327 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4797  peptidase M23B  45.05 
 
 		 327 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0231137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  41.06 
 
 		 272 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  37.1 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2907  Peptidase M23  36.29 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  38.05 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  35.16 
 
 		 392 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0813  peptidase M23B  31.54 
 
 		 548 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  34.71 
 
 		 223 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  35.51 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  38.35 
 
 		 844 aa  63.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  35.85 
 
 		 751 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  35.4 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  35.85 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  31.75 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  32.28 
 
 		 199 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  35.85 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  38.38 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  33.61 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  34.48 
 
 		 183 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  34.23 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  31.71 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  35.96 
 
 		 174 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  33.88 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  34.43 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0737  Peptidase M23  32.79 
 
 		 580 aa  57.4  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.200765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  33.96 
 
 		 754 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  35.4 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  34.51 
 
 		 194 aa  57  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  34.91 
 
 		 727 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  34.91 
 
 		 727 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  35.4 
 
 		 651 aa  56.2  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  35.4 
 
 		 651 aa  56.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1555  Peptidase M23  30.91 
 
 		 469 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  33.78 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1579  Peptidase M23  30.91 
 
 		 469 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  34.23 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  35.29 
 
 		 665 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  32.04 
 
 		 697 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  32.04 
 
 		 697 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  36.61 
 
 		 651 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  30.08 
 
 		 462 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0565  Peptidase M23  30.39 
 
 		 475 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  30.95 
 
 		 590 aa  54.7  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  30.4 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  30.15 
 
 		 441 aa  54.3  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  31.07 
 
 		 699 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  35.29 
 
 		 695 aa  54.3  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  33.61 
 
 		 375 aa  53.9  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.27 
 
 		 287 aa  53.5  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  31.07 
 
 		 735 aa  53.5  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  34.31 
 
 		 475 aa  53.5  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  32.82 
 
 		 503 aa  53.5  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  32.74 
 
 		 196 aa  53.1  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  30.97 
 
 		 687 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  35.34 
 
 		 477 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  35.71 
 
 		 648 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  35 
 
 		 460 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  28.47 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  33.04 
 
 		 645 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  34.21 
 
 		 646 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  30.19 
 
 		 529 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  36.54 
 
 		 475 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  34.48 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  36.54 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  34.55 
 
 		 347 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  31.07 
 
 		 681 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  36.54 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  33.66 
 
 		 340 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  36.54 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  35.29 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  33.33 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  32.35 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  36.47 
 
 		 439 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  31.07 
 
 		 676 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  36.11 
 
 		 489 aa  51.2  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  38.37 
 
 		 577 aa  50.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  31.37 
 
 		 468 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  31.37 
 
 		 468 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  31.97 
 
 		 316 aa  50.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  31.37 
 
 		 468 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  33.33 
 
 		 276 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  31.37 
 
 		 468 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  34.23 
 
 		 676 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  31.45 
 
 		 411 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0197  peptidase M23B  34.86 
 
 		 192 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00125912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  38.37 
 
 		 581 aa  50.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  32.35 
 
 		 491 aa  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>