More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3948 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  100 
 
 		 311 aa  608  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  60.77 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  59.69 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7995  Peptidase M23  54.47 
 
 		 536 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  54.93 
 
 		 669 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  49.23 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  49.23 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  40.7 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  52.94 
 
 		 348 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  42.18 
 
 		 387 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  46.88 
 
 		 392 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  40.79 
 
 		 456 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  45.24 
 
 		 491 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  53.54 
 
 		 468 aa  106  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  40.13 
 
 		 453 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  52.48 
 
 		 455 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  43.41 
 
 		 430 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  37.63 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 590 aa  105  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  46.15 
 
 		 455 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  51 
 
 		 824 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  46.88 
 
 		 391 aa  105  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  50.49 
 
 		 727 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  50.49 
 
 		 727 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  52.43 
 
 		 195 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  41.54 
 
 		 423 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  47.33 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  47.27 
 
 		 452 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  39.47 
 
 		 459 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  53.4 
 
 		 411 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  39.86 
 
 		 450 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  51.96 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  50 
 
 		 482 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  52.63 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  49.59 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  43.75 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  47.9 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  39.61 
 
 		 457 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  49 
 
 		 751 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  48.54 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  52.53 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  39.23 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  55.06 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  45.8 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  46.26 
 
 		 472 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  46.26 
 
 		 471 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  40.91 
 
 		 454 aa  99.4  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  46.26 
 
 		 512 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  47.29 
 
 		 442 aa  99.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  53.68 
 
 		 538 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  41.86 
 
 		 237 aa  99.4  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  38.17 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  42.86 
 
 		 582 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  46.26 
 
 		 509 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  46.26 
 
 		 470 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  41.09 
 
 		 236 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  45.04 
 
 		 523 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  51.49 
 
 		 430 aa  97.8  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  47.86 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  54 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  41.88 
 
 		 229 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  50 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  42.74 
 
 		 198 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  45.39 
 
 		 499 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  49.55 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  52.53 
 
 		 404 aa  96.3  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  41.88 
 
 		 198 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  46.03 
 
 		 460 aa  95.9  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  46.3 
 
 		 333 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  39.6 
 
 		 375 aa  95.9  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  45.38 
 
 		 414 aa  95.5  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  44.07 
 
 		 347 aa  95.9  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  42.19 
 
 		 340 aa  95.9  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  44.66 
 
 		 360 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  46.9 
 
 		 386 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  39.57 
 
 		 439 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  41.43 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  40.29 
 
 		 440 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  50.49 
 
 		 445 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  46.85 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  46.85 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  45 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  44.35 
 
 		 399 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  49.51 
 
 		 446 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  42.65 
 
 		 569 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  46.9 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  47.83 
 
 		 362 aa  93.6  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  47.22 
 
 		 511 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  52.38 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  44.63 
 
 		 681 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  52.48 
 
 		 415 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  51 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  50.51 
 
 		 446 aa  93.2  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  53.68 
 
 		 376 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  49.49 
 
 		 305 aa  92.8  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  49.53 
 
 		 464 aa  92.8  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  46.39 
 
 		 467 aa  92.8  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  48.04 
 
 		 402 aa  92.8  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  41.27 
 
 		 446 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  45.54 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>