More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3774 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  100 
 
 
266 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  55.49 
 
 
321 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  59.69 
 
 
311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7995  Peptidase M23  40.54 
 
 
536 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  36.33 
 
 
269 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  52.76 
 
 
472 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  52.76 
 
 
471 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  52.76 
 
 
512 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  52.76 
 
 
509 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  52.76 
 
 
470 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  45.38 
 
 
236 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  51.61 
 
 
499 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  46.92 
 
 
237 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  39.11 
 
 
351 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  48.84 
 
 
412 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  37.58 
 
 
452 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  48.84 
 
 
421 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  48.84 
 
 
421 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  46.76 
 
 
334 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  48.84 
 
 
400 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  48.06 
 
 
420 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  48.85 
 
 
271 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  53.12 
 
 
350 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  48.06 
 
 
425 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  48.06 
 
 
425 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  52.99 
 
 
669 aa  105  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  53.12 
 
 
350 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  34.01 
 
 
231 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  30.11 
 
 
295 aa  104  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  38.55 
 
 
348 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  44.53 
 
 
360 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  44.53 
 
 
360 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  44.36 
 
 
283 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  44.53 
 
 
360 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  45.19 
 
 
332 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  38.8 
 
 
340 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  46.67 
 
 
320 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  31.11 
 
 
379 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  43.7 
 
 
491 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  42.64 
 
 
824 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  44.53 
 
 
339 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  45.86 
 
 
270 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  43.8 
 
 
340 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  43.8 
 
 
340 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  48.51 
 
 
375 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  55.67 
 
 
352 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  41.51 
 
 
284 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  44.36 
 
 
460 aa  99.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  46.38 
 
 
392 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  46.6 
 
 
446 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  44.62 
 
 
372 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  43.8 
 
 
339 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  45.07 
 
 
383 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  30.49 
 
 
582 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  43.31 
 
 
399 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  50 
 
 
465 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  49.15 
 
 
448 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  40.16 
 
 
363 aa  97.1  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  43.48 
 
 
391 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  44.78 
 
 
454 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  39.53 
 
 
198 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  37.89 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  47.58 
 
 
195 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  39.86 
 
 
438 aa  97.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  41.86 
 
 
375 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  44.93 
 
 
392 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  45.16 
 
 
442 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  52.04 
 
 
462 aa  96.3  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  52.63 
 
 
457 aa  96.3  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  39.53 
 
 
198 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  42.77 
 
 
377 aa  95.9  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  42.06 
 
 
445 aa  96.3  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  41.72 
 
 
450 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  43.61 
 
 
251 aa  95.9  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  42.54 
 
 
465 aa  95.9  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  33.33 
 
 
303 aa  95.5  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  41.06 
 
 
523 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  43.75 
 
 
727 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  43.75 
 
 
727 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  42.52 
 
 
399 aa  95.5  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  42.98 
 
 
309 aa  95.5  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  43.08 
 
 
377 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  41.94 
 
 
387 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  41.46 
 
 
398 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  47.93 
 
 
415 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  48.51 
 
 
454 aa  93.6  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  48.96 
 
 
538 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  42.86 
 
 
345 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  50.51 
 
 
464 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  47.32 
 
 
372 aa  93.2  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  48.51 
 
 
454 aa  93.2  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  44.25 
 
 
468 aa  92.8  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  42.31 
 
 
373 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  42.31 
 
 
372 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  40.44 
 
 
362 aa  92.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  42.19 
 
 
430 aa  92.8  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  41.94 
 
 
402 aa  92.8  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  47.12 
 
 
751 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  36.42 
 
 
283 aa  92.4  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  46.15 
 
 
649 aa  92.4  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>