More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1119 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  100 
 
 		 669 aa  1296    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3335  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  52.31 
 
 		 579 aa  143  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0595  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49.23 
 
 		 415 aa  140  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0368  hypothetical protein  52.71 
 
 		 368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.912382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8657  hypothetical protein  52.34 
 
 		 348 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0901  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49.61 
 
 		 350 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1895  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  50 
 
 		 449 aa  131  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0812  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  48.46 
 
 		 432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0084  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.66 
 
 		 722 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334729  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0587  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  49.21 
 
 		 404 aa  120  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1636  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  45.38 
 
 		 407 aa  120  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  54.93 
 
 		 311 aa  118  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0997  NLP/P60 protein  50.78 
 
 		 669 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  48.46 
 
 		 392 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.92 
 
 		 386 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3081  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.15 
 
 		 410 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.66 
 
 		 391 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0392  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.19 
 
 		 484 aa  114  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3194  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.85 
 
 		 358 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  43.92 
 
 		 399 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4092  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.03 
 
 		 368 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240127 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  43.24 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  45.97 
 
 		 468 aa  110  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  49.62 
 
 		 372 aa  110  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2520  hydrophobic protein  40.22 
 
 		 461 aa  110  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  45.31 
 
 		 379 aa  107  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1224  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.56 
 
 		 285 aa  105  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  52.99 
 
 		 266 aa  105  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.71 
 
 		 396 aa  105  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  54.05 
 
 		 321 aa  104  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  45.67 
 
 		 288 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2482  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.78 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  53.54 
 
 		 293 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  42.22 
 
 		 453 aa  102  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  41.61 
 
 		 347 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  48.55 
 
 		 348 aa  101  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  40.31 
 
 		 285 aa  100  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  38.52 
 
 		 244 aa  100  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  43.55 
 
 		 309 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  39.26 
 
 		 273 aa  100  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  44.62 
 
 		 455 aa  99.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  41.22 
 
 		 377 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  53.19 
 
 		 376 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  43.85 
 
 		 454 aa  99  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  42.22 
 
 		 455 aa  99  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  42.97 
 
 		 375 aa  99  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  51 
 
 		 319 aa  98.6  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  47.41 
 
 		 402 aa  98.2  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  46.22 
 
 		 414 aa  98.2  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  41.67 
 
 		 375 aa  97.8  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  50 
 
 		 238 aa  97.8  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  48.09 
 
 		 238 aa  98.2  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  42.86 
 
 		 290 aa  97.4  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  48.03 
 
 		 238 aa  97.4  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  42.86 
 
 		 316 aa  97.4  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  43.55 
 
 		 491 aa  97.1  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  45.65 
 
 		 383 aa  97.1  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  49.15 
 
 		 297 aa  96.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  39.84 
 
 		 445 aa  97.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  41.8 
 
 		 456 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  44.88 
 
 		 277 aa  96.3  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  48.57 
 
 		 498 aa  95.9  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  39.71 
 
 		 430 aa  95.9  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  51.89 
 
 		 1048 aa  96.3  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  51 
 
 		 328 aa  95.9  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  38.52 
 
 		 266 aa  95.5  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  43.75 
 
 		 482 aa  95.5  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  47.92 
 
 		 482 aa  95.5  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  48.7 
 
 		 332 aa  95.5  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  42.19 
 
 		 373 aa  95.1  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1799  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.96 
 
 		 558 aa  95.1  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  43.86 
 
 		 527 aa  94.7  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  41.23 
 
 		 268 aa  94.4  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  41.54 
 
 		 457 aa  94.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  50.5 
 
 		 288 aa  94.4  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  40.77 
 
 		 459 aa  94.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.86 
 
 		 321 aa  94  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  46.46 
 
 		 303 aa  94.4  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  43.36 
 
 		 314 aa  94  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  39.23 
 
 		 443 aa  94  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  40.15 
 
 		 404 aa  93.6  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  45.67 
 
 		 253 aa  94  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  42.75 
 
 		 300 aa  94  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  42.74 
 
 		 387 aa  93.6  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  43.08 
 
 		 414 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1104  peptidase M23B  43.88 
 
 		 444 aa  93.6  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109344  decreased coverage  0.00201556 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  43.08 
 
 		 452 aa  93.6  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  45.67 
 
 		 287 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  41.41 
 
 		 392 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  47.06 
 
 		 269 aa  93.2  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  49 
 
 		 327 aa  92.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  42.98 
 
 		 391 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  41.41 
 
 		 375 aa  92.8  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  41.55 
 
 		 490 aa  92  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  40.62 
 
 		 392 aa  92  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  36.51 
 
 		 395 aa  92  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  48.48 
 
 		 276 aa  92  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  42.86 
 
 		 265 aa  92  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  50 
 
 		 232 aa  91.3  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  42.15 
 
 		 464 aa  91.3  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>