62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1799 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1799  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 		 558 aa  1105    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09610  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  47.56 
 
 		 294 aa  202  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.340149  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1224  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.83 
 
 		 285 aa  184  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2482  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42 
 
 		 447 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8657  hypothetical protein  43.9 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0392  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  51.82 
 
 		 484 aa  116  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0084  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.53 
 
 		 722 aa  116  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334729  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0901  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.76 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0368  hypothetical protein  45.97 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.912382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4092  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.59 
 
 		 368 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1636  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.86 
 
 		 407 aa  111  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  42.96 
 
 		 669 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0595  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.75 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0812  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.22 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130702 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0587  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  40.16 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1895  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.53 
 
 		 449 aa  105  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.08 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3335  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.8 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3194  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.15 
 
 		 358 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3081  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.86 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  42.31 
 
 		 392 aa  100  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.47 
 
 		 396 aa  99  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0997  NLP/P60 protein  44 
 
 		 669 aa  98.2  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21560  SH3 domain-containing protein  41.67 
 
 		 442 aa  97.8  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0436482  hitchhiker  0.000261973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0583  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.91 
 
 		 334 aa  94  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  hitchhiker  0.000670558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2520  hydrophobic protein  38.64 
 
 		 461 aa  94  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534739  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.62 
 
 		 391 aa  93.6  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2374  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.3 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2185  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.21 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0123  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  36.92 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.172255 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22690  SH3 domain-containing protein  33.1 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4580  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.3 
 
 		 246 aa  62.4  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1961  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.89 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08221  putative carboxypeptidase  29.73 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35520  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  39.13 
 
 		 196 aa  57  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.423821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08231  putative carboxypeptidase  30.63 
 
 		 237 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0769  putative carboxypeptidase  29.73 
 
 		 237 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1631  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.33 
 
 		 263 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.303902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.53 
 
 		 259 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.46 
 
 		 259 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1371  carboxypeptidase-like protein  31.33 
 
 		 263 aa  52  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.919342  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08211  putative carboxypeptidase  31.13 
 
 		 182 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.46 
 
 		 259 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.46 
 
 		 259 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.46 
 
 		 259 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.46 
 
 		 259 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10021  putative carboxypeptidase  31.58 
 
 		 248 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.127155 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.46 
 
 		 259 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1919  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.12 
 
 		 246 aa  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.77 
 
 		 259 aa  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2970  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  29.73 
 
 		 272 aa  48.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.01 
 
 		 259 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4445  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  32.67 
 
 		 284 aa  47.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1672  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  28.36 
 
 		 241 aa  46.6  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.77 
 
 		 259 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.68 
 
 		 259 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2308  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.2 
 
 		 173 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000166242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2349  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.32 
 
 		 243 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  29.36 
 
 		 269 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2526  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.32 
 
 		 243 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2541  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.32 
 
 		 243 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35548e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2266  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.32 
 
 		 243 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0349976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>