85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3194 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3194  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 		 358 aa  735    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8657  hypothetical protein  52.94 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0901  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  48.57 
 
 		 350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0368  hypothetical protein  41.08 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.912382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4092  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.81 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0812  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  53.38 
 
 		 432 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1895  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  53.91 
 
 		 449 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3335  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  53.12 
 
 		 579 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3081  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  53.49 
 
 		 410 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0587  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  51.61 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  46.85 
 
 		 669 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1224  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.18 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.15 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0595  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49.22 
 
 		 415 aa  123  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0997  NLP/P60 protein  49.22 
 
 		 669 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.85 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0392  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.27 
 
 		 484 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1636  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.29 
 
 		 407 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.53 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0084  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.77 
 
 		 722 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334729  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  48.08 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21560  SH3 domain-containing protein  39.58 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0436482  hitchhiker  0.000261973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1799  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.15 
 
 		 558 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2374  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  45.04 
 
 		 495 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2482  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.16 
 
 		 447 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09610  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  39.72 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.340149  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2520  hydrophobic protein  37.5 
 
 		 461 aa  90.5  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534739  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2185  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.85 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0583  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.97 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  hitchhiker  0.000670558 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35520  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  39.39 
 
 		 196 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.423821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0123  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.29 
 
 		 232 aa  68.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.172255 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4580  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.83 
 
 		 246 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1961  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.82 
 
 		 245 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.69 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22690  SH3 domain-containing protein  33.33 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.05 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.24 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.05 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.41 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.24 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.24 
 
 		 259 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.24 
 
 		 259 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.24 
 
 		 259 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.24 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  33.33 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1672  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  30.71 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1631  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.17 
 
 		 263 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.303902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1371  carboxypeptidase-like protein  31.17 
 
 		 263 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.919342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.82 
 
 		 259 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.92 
 
 		 244 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08231  putative carboxypeptidase  30.17 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2970  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  33.71 
 
 		 272 aa  50.4  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3932  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.88 
 
 		 264 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.04 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0769  putative carboxypeptidase  27.56 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08211  putative carboxypeptidase  30.17 
 
 		 182 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1241  putative carboxypeptidase  31.06 
 
 		 250 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3270  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.77 
 
 		 246 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2828  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.77 
 
 		 246 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1919  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.03 
 
 		 246 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4445  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  26.43 
 
 		 284 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10021  putative carboxypeptidase  26.28 
 
 		 248 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.127155 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2141  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.57 
 
 		 246 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2169  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.57 
 
 		 246 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.742674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.15 
 
 		 448 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2250  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.7 
 
 		 303 aa  46.2  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0294681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2059  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.4 
 
 		 246 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08221  putative carboxypeptidase  25.66 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1238  putative carboxypeptidase  29.32 
 
 		 267 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.588362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.4 
 
 		 246 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000420976  normal  0.257311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1388  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.48 
 
 		 291 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.423501  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0595  putative carboxypeptidase  25.71 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07971  putative carboxypeptidase  26.55 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.999242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2101  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.78 
 
 		 246 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1923  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.78 
 
 		 246 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1885  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.78 
 
 		 246 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.699634  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1875  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.95 
 
 		 246 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2070  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.78 
 
 		 246 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1721  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.09 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000495167  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0165  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  25.66 
 
 		 236 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2421  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.05 
 
 		 273 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1934  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.58 
 
 		 239 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.3783  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3298  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.58 
 
 		 243 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1686  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.62 
 
 		 247 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000186356  hitchhiker  5.41079e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3005  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  25.95 
 
 		 243 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>