64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0587 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0587  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  100 
 
 
404 aa  789    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.383257  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0368  hypothetical protein  32.37 
 
 
368 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.912382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4092  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.09 
 
 
368 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.240127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0901  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.3 
 
 
350 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3335  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  54.62 
 
 
579 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8657  hypothetical protein  29.4 
 
 
348 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0812  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  54.76 
 
 
432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3194  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.06 
 
 
358 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0997  NLP/P60 protein  52.74 
 
 
669 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1895  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  51.94 
 
 
449 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.14 
 
 
386 aa  132  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1636  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.29 
 
 
407 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  51.52 
 
 
391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  50 
 
 
392 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0595  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  50.39 
 
 
415 aa  126  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  49.22 
 
 
669 aa  122  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  53.27 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3081  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.09 
 
 
410 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2520  hydrophobic protein  44.37 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534739  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0084  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  41.86 
 
 
722 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334729  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0392  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.18 
 
 
484 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150656  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1224  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40 
 
 
285 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09610  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  39.16 
 
 
294 aa  93.2  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.340149  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1799  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.16 
 
 
558 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295966  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2482  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.71 
 
 
447 aa  86.7  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0583  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.73 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  hitchhiker  0.000670558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2374  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.37 
 
 
495 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21560  SH3 domain-containing protein  36.36 
 
 
442 aa  79  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0436482  hitchhiker  0.000261973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2185  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.38 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4580  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.64 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1961  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.88 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0123  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.4 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.172255 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35520  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.59 
 
 
196 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.423821  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  35.21 
 
 
269 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.8 
 
 
259 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22690  SH3 domain-containing protein  31.07 
 
 
447 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.14 
 
 
259 aa  53.9  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.5 
 
 
259 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.5 
 
 
259 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.5 
 
 
259 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.5 
 
 
259 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.5 
 
 
259 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.89 
 
 
448 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1902  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.16 
 
 
202 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.5 
 
 
259 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.14 
 
 
259 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1968  peptidase  35.16 
 
 
187 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.5 
 
 
259 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.24 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10021  putative carboxypeptidase  29.91 
 
 
248 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.127155 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30.71 
 
 
259 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2187  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.66 
 
 
230 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.222762  normal  0.0101242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.37 
 
 
244 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1388  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.67 
 
 
291 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.423501  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07971  putative carboxypeptidase  35.71 
 
 
210 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.999242 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1238  putative carboxypeptidase  32.28 
 
 
267 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.588362  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3932  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.69 
 
 
264 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2237  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  40.98 
 
 
516 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120186  hitchhiker  0.00817186 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0165  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  34.29 
 
 
236 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16751  putative carboxypeptidase  31.25 
 
 
243 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1371  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.11 
 
 
225 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3140  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.11 
 
 
225 aa  43.1  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1254  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.11 
 
 
225 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1672  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  33.07 
 
 
241 aa  43.1  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>