63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1895 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1895  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 		 449 aa  865    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8657  hypothetical protein  42.13 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3335  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  51.47 
 
 		 579 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0901  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.58 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0812  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  52.45 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0084  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  53.73 
 
 		 722 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334729  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1636  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  51.91 
 
 		 407 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0595  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  48.89 
 
 		 415 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3194  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  53.91 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0368  hypothetical protein  52.31 
 
 		 368 aa  137  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.912382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3081  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49.23 
 
 		 410 aa  136  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.26 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  50 
 
 		 669 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0997  NLP/P60 protein  51.94 
 
 		 669 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4092  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.24 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  53.51 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0392  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.88 
 
 		 484 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  45.38 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09610  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  48.23 
 
 		 294 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.340149  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2482  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.53 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.53 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1224  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.17 
 
 		 285 aa  112  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2520  hydrophobic protein  37.4 
 
 		 461 aa  98.6  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534739  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1799  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.88 
 
 		 558 aa  93.6  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2374  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.74 
 
 		 495 aa  87  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4580  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.88 
 
 		 246 aa  85.5  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21560  SH3 domain-containing protein  36.96 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0436482  hitchhiker  0.000261973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0583  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.96 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  hitchhiker  0.000670558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1961  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  39.42 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35520  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  39.04 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.423821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0123  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.29 
 
 		 232 aa  79.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.172255 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2185  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  38.06 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22690  SH3 domain-containing protein  31.43 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  31.51 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0165  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  26.12 
 
 		 236 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1371  carboxypeptidase-like protein  27.52 
 
 		 263 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.919342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1631  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  27.52 
 
 		 263 aa  53.1  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.303902  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4445  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  30.2 
 
 		 284 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3932  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.56 
 
 		 264 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07971  putative carboxypeptidase  26.12 
 
 		 210 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.999242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1672  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  33.08 
 
 		 241 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2970  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  33.82 
 
 		 272 aa  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1241  putative carboxypeptidase  30.08 
 
 		 250 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.6 
 
 		 244 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16751  putative carboxypeptidase  31.01 
 
 		 243 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2250  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.76 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0294681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.01 
 
 		 246 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08231  putative carboxypeptidase  30.56 
 
 		 237 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05720  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  36.76 
 
 		 275 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.435379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08221  putative carboxypeptidase  30.56 
 
 		 243 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0495  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.66 
 
 		 332 aa  47.4  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.798346  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0769  putative carboxypeptidase  30.56 
 
 		 237 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1721  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.09 
 
 		 321 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000495167  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08211  putative carboxypeptidase  30.56 
 
 		 182 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  25.47 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1238  putative carboxypeptidase  27.48 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.588362  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10021  putative carboxypeptidase  30.34 
 
 		 248 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.127155 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1968  peptidase  28.57 
 
 		 187 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1902  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  28.57 
 
 		 202 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2237  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  43.75 
 
 		 516 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120186  hitchhiker  0.00817186 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2828  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.46 
 
 		 246 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3270  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  29.46 
 
 		 246 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0633  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase, putative  32.17 
 
 		 266 aa  43.9  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>