96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0595 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0595  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  100 
 
 
415 aa  805    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1636  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  47.62 
 
 
407 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0642  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.1 
 
 
386 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3081  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  51.54 
 
 
410 aa  150  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0109  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  55 
 
 
396 aa  150  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0084  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.85 
 
 
722 aa  146  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0440  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  53.85 
 
 
392 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0392  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.85 
 
 
484 aa  143  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150656  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  49.23 
 
 
669 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1895  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  48.89 
 
 
449 aa  140  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3335  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  50.76 
 
 
579 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1952  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  50 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.383383  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0997  NLP/P60 protein  50.39 
 
 
669 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0587  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  49.61 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.383257  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0901  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  45.38 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0812  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.92 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130702 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1224  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49.22 
 
 
285 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2482  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.75 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8657  hypothetical protein  42.19 
 
 
348 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0368  hypothetical protein  30.88 
 
 
368 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.912382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2374  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  43.31 
 
 
495 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0583  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  44.85 
 
 
334 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146091  hitchhiker  0.000670558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2520  hydrophobic protein  39.05 
 
 
461 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3194  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  49.22 
 
 
358 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09610  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  42.64 
 
 
294 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.340149  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4092  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  40.94 
 
 
368 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.240127 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21560  SH3 domain-containing protein  39.69 
 
 
442 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0436482  hitchhiker  0.000261973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1799  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  37.29 
 
 
558 aa  98.2  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295966  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22690  SH3 domain-containing protein  37.86 
 
 
447 aa  92  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2185  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.97 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0123  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  35.25 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.172255 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1961  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.09 
 
 
245 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4580  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.58 
 
 
246 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35520  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  35.51 
 
 
196 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.423821  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4342  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.59 
 
 
259 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3932  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.72 
 
 
264 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1672  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  33.8 
 
 
241 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0613  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.59 
 
 
259 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0633  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase, putative  31.37 
 
 
266 aa  57.4  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1196  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.41 
 
 
244 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206054 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4622  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.59 
 
 
259 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4642  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.81 
 
 
259 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.218213  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1631  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.64 
 
 
263 aa  56.6  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.303902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1371  carboxypeptidase-like protein  33.64 
 
 
263 aa  56.6  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.919342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4626  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.03 
 
 
259 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4410  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.03 
 
 
259 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.03 
 
 
259 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4261  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.03 
 
 
259 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4750  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.03 
 
 
259 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08221  putative carboxypeptidase  26.92 
 
 
243 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4641  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.25 
 
 
259 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0259  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.15 
 
 
286 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0170483  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3438  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30.41 
 
 
246 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425893 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4445  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  27.44 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585911  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4978  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.15 
 
 
286 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3580  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  30.3 
 
 
269 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0595  putative carboxypeptidase  25.71 
 
 
262 aa  51.2  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10021  putative carboxypeptidase  29.01 
 
 
248 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.127155 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08231  putative carboxypeptidase  29.63 
 
 
237 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4581  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.1 
 
 
286 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0769  putative carboxypeptidase  33.77 
 
 
237 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1241  putative carboxypeptidase  28.26 
 
 
250 aa  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1238  putative carboxypeptidase  28.06 
 
 
267 aa  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.588362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2141  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.08 
 
 
246 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0859395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2070  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.08 
 
 
246 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1875  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.08 
 
 
246 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1885  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.08 
 
 
246 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.699634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2101  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.08 
 
 
246 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2169  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.08 
 
 
246 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.742674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1923  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.08 
 
 
246 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2970  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  34.26 
 
 
272 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05720  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  41.79 
 
 
275 aa  48.9  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.435379  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3249  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.82 
 
 
246 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000420976  normal  0.257311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2059  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  32.82 
 
 
246 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4743  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.1 
 
 
286 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2541  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.59 
 
 
243 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35548e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5104  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.1 
 
 
286 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2828  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.97 
 
 
246 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4961  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  28.1 
 
 
286 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3270  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  27.97 
 
 
246 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4989  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  29.51 
 
 
286 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.43 
 
 
286 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4603  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.51 
 
 
286 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.336858  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08211  putative carboxypeptidase  29.63 
 
 
182 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1919  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.31 
 
 
246 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5008  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  31.18 
 
 
286 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1388  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.11 
 
 
291 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.423501  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3213  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  31.25 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1899  M15B family D-Ala-D-Ala carboxypeptidase VanY  32.38 
 
 
289 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3126  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  30 
 
 
248 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4758  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  34.29 
 
 
241 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1813  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  33.77 
 
 
238 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.877549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1686  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  30 
 
 
247 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000186356  hitchhiker  5.41079e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1557  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  26.9 
 
 
246 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260228  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04455  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family  34.31 
 
 
265 aa  43.1  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2421  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  33.64 
 
 
273 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>